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Chapter 9 真核基因表达调控
Chapter 9 真核基因表达调控;9.1 概述
9.2 DNA水平的调控
9.3 转录水平的调控
9.4 转录后水平的调控
9.5 翻译水平的调控;9.1 概述; 首先,从基因组的构成来看,真核生物的基因数目远远比原核生物多,且大多数基因含有内含子;基因组中除了基因之外,还含有数量庞大的重复序列和单一序列,有的对基因的表达产生影响。基因组DNA与组蛋白包装成核小体,直至更高级的结构,并结合很多非组蛋白。这些都对表达调控产生影响。; 其次,从基因表达特点来看,真核生物中,转录和翻译分别在细胞核与细胞质中进行,不存在偶联,因而不具有衰减调控机制,但是绝大多数mRNA都要经过拼接加工才能成熟,真核细胞在这一层次存在相应的调控机制。真核细胞的mRNA的寿命一般较长,为翻译调控提供了很大余地。所以,与原核细胞的表达调控主要发生在转录水平相比,真核生物基因表??的调控范围更广,包括DNA水平(基因拷贝数和重排)、转录水平、转录后水平(RNA的加工和运输)、翻译水平、翻译后水平等,但仍以转录水平为最主要的调控方式。; 第三,从生长发育角度来看,真核生物个体发育从一个受精卵开始,经过细胞的分裂、生长、分化产生各种类型的细胞和组织器官,是细胞中不同类别的基因表达的结果,是按照特定的“计划” 在特定的时间和特定的部位,对不同类群的基因不断进行严格调控才实现的。这样个体发育就呈现出严格的时空特性。
而原核生物则是同一群体内,各个细胞的基因表达基本一致。; 此外,真核生物的调控以正调控为主,原核生物的调控以负调控为主。;附:
真核生物与原核生物在基因组结构、转录、翻译等方面存在的差异
1、真核细胞的DNA与组蛋白和非组蛋白形成染色体,进少量DNA称裸露状态;而原核生物DNA上只有少量蛋白结合。
2、高等真核生物的DNA很大一部分是不转录的,存在大量的重复序列,基因中有内含子存在;原核生物基本不具备这样的特点。;3、真核生物可根据生长发育等需要进行DNA的重排,还能特异地增加某些基因的拷贝数(基因扩增);原核细胞一般不具备这样的能力。
4、原核细胞中基因的调控区一般很小,且多位于转录起始点的上游不远处,往往通过直接与RNA聚合酶相互作用来影响转录;而真核细胞中基因的调控区域往往较大,调控因子一般通过调控区DNA构象的改变来影响RNA聚合酶与启动子的结合。;5、真核生物的转录和翻译过程在空间上是分隔开的,分别在核内和胞质中进行;而原核细胞内由于没有明显的空间分隔,转录和翻译偶联。
6、绝大多数情况下,真核生物一条成熟的mRNA只能翻译出一条肽链;而原核生物mRNA中有许多是多基因的。
7、 真核生物的基因在转录和翻译之间有一个复杂的处理有内含子的剪接过程;而原核生物则没有。; 根据调控的可逆与否,真核生物的基因表达调控可以分为瞬时调控(或称可逆调控)与发育调控(或称不可逆调控)。
前者相当于原核细胞对外部环境所做出的反应,包括底物和激素水平的变化,以及细胞周期不同阶段酶活性的调节。
后者是真核细胞调控的核心内容,它决定了真核细胞生长分化发育的的过程。; DNA和染色体水平的调控
转录水平的调控
转录后RNA加工过程和运送中的调控
翻译水平的调控
翻译后的控制;Figure 9.1;9.1.4 研究表达调控时应着重关心的问题:
诱发调控的信号
调控主要发生在哪一步
调控的分子机制
调控的结果;9.1.5 转录组、持家基因和奢侈基因
转录组(transcriptome)是指在一种细胞、组织或生物中的全套的RNA。其复杂程度主要源于mRNA,但也包括非编码RNA。
The transcriptome is the complete set of RNAs present in a cell, tissue, or organism. Its complexity is due mostly to mRNAs, but it also includes noncoding RNAs.;持家基因(house keeping gene, constitutive gene)是指那些(理论上)在所有细胞类型都表达的基因,赋予各种细胞维持所需的基本功能。
Housekeeping genes?(Constitutive gene) are those (theoretically) expressed in all cells because they provide basic functions needed for sustena
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