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基因工程ppt04

第4章 人工染色体载体 黏粒载体 酵母人工染色体载体 细菌人工染色体载体 P1噬菌体载体和P1人工染色体载体 表4-1 5种常见高容量克隆载体及其基本特性 载体 容量(kb) 复制子 宿主 拷贝数 重组DNA导入宿主的方式 筛选标记 克隆DNA获取方法 黏粒 30-45 ColE1 大肠杆菌 高 转导 — 碱抽提 P1 70-100 P1 大肠杆菌 1 转导 sacB PAC 130-150 P1 大肠杆菌 1 电转化 sacB BAC 120-300 F 大肠杆菌 1 电转化 α-互补 YAC 250-400 ARS 酵母菌 1 转化 ade2 脉冲场电泳 4.1 黏粒载体 4.1.1 黏粒的结构特征和用途 黏粒(cosmid)是质粒的衍生物,是带有cos序列的质粒。cos序列是?噬菌体DNA中将DNA包装到噬菌体颗粒中所需的DNA序列。 黏粒的组成包括质粒复制起点(ColE1)、抗性标记(ampr)、cos位点,能像质粒一样转化和增殖。 它的大小:5-7kb,用来克隆大片段DNA,克隆的最大DNA片段可达45kb。 4.1.2 黏粒载体的工作原理 图4-1 黏粒载体克隆DNA的一般原理和步骤 4.1.3 黏粒克隆载体 1.黏粒pJB8 大小为5.4kb,由ampr,ColE1复制起点(ori),cos位点,多克隆位点组成,可容纳33-46.5kb外源DNA片段(图4-2),主要用来在细菌中克隆真核DNA。 图4-2 pJB8图谱 2.含双cos位点的黏粒载体 c2RB和Supercos-1是含双cos位点的黏粒载体,c2RB大小为6.8kb,含两个cos位点,在cos位点之间有Kanr(图4-3)。 装载容量33-46.5kb 图4-3 黏粒载体c2RB图谱 4.2.1 YAC载体的复制元件和标记基因 最常用的是pYAC4。 工作状态:线状的。 为了方便制备YAC载体,YAC载体以环状的方式存在,并增加了普通大肠杆菌质粒载体的复制元件和选择标记。 YAC载体必须含有元件 YAC载体为能够满足自主复制、染色体在子代细胞间的分离及保持染色体稳定的需要,必须含有以下元件: ①端粒重复序列(telomeric repeat, TEL),定位于染色体末端一段序列,用于保护线状的DNA不被胞内的核酸酶降解,以形成稳定的结构。 ②着丝粒(centromere, CEN),有丝分裂过程中纺锤丝的结合位点,使染色体在分裂过程中能正确分配到子细胞中。在YAC中起到保证一个细胞内只有一个人工染色体的作用。如pYAC4使用的是酵母第四条染色体的着丝粒。 ③自主复制序列(autonomously replication sequences,ARS)一段特殊的序列,含有酵母菌中DNA进行双向复制所必须的信号。 YAC载体的选择标记 采用营养缺陷型基因,如色氨酸、亮氨酸和组氨酸合成缺陷型基因trp1、leu2和his3、尿嘧啶合成缺陷型基因ura3等,以及赭石突变抑制基因sup4。 与YAC载体配套工作的宿主酵母菌(如AB1380)的胸腺嘧啶合成基因带有一个赭石突变ade2-1。带有这个突变的酵母菌在基本培养基上形成红色菌落,当带有赭石突变抑制基因sup4的载体存在于细胞中时,可抑制ade2-1基因的突变效应,形成正常的白色菌落。 利用这一菌落颜色转变的现象,可用于筛选载体中含有外源DNA片段插入的重组子。 宿主菌:赭石突变:突变为 UAA,红色菌落 载体上:赭石突变抑制基因sup4 4.2.2 YAC载体的工作原理 YAC载体主要是用来构建大片段DNA文库,特别用来构建高等真核生物的基因组文库。 图4-5 酵母人工染色体载体 图4-6 pYAC4载体工作原理图 外源DNA片段的装载导致抑制基因sup4插入失活,使重组菌形成红色菌落; 载体自身连接转入到酵母细胞后形成白色菌落。 4.3 细菌人工染色体载体 细菌人工染色体是基于大肠杆菌的F质粒构建的高通量低拷贝的质粒载体。 F质粒是一个约100kb的质粒,编码60多种参与复制、分配和接合过程的蛋白质。 虽然F质粒通常以双链闭环DNA(1-2拷贝/细胞)的形式存在,但它可以在大肠杆菌染色体中至少30个位点处进行随机整合。 携带F质粒的细胞(以游离状态或以整合状态)可表达发样状的性菌毛,通过性菌毛F质粒可以转移给受体细胞。 4.3.1 BAC载体及其结构组成 约7.5kb,其本质实际上是一个质粒克隆载体。 复制单元的特殊性:来自F质粒,包括严谨型控制的复制区oriS,启动DNA复制的由ATP驱动的解旋酶(RepE)以及3个确保低拷贝质粒精确分配至子代细胞的基因座(parA、parB和parC)。 低拷贝性可以减小外源基因的表达产物对宿主细胞的毒副作用。 标记基因:氯霉素抗性基因 图4-7 B

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