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第七章 基因操作与克隆载体
四、常用的载体 (2)质粒DNA的构型 ? SC(CCC covalently close circular DNA )构型:两条 核苷酸链均保持着完整的环形结构,DNA呈现超螺旋。 ? OC(open circularDNA)构型:两条链中只有一条保持着完整的环形结构,另一条链出现缺口,称之为开环DNA。 ? L(linear构型:DNA的双链均发生断裂而形成线性分 子。 四、常用的载体 ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 四、常用的载体 四、常用的载体 (3)质粒的命名原则 ? 用小写字母p代表质粒,在p字母后面用两个大 写字母代表发现这一质粒的作者或实验室名 称。后面的数字是构建质粒的编号。如: pUC18和pBR322。 (4)质粒的构建 ? 加入合适的选择标记基因,通常是抗生素基因。 ? 增加或减少合适的酶切位点,便于重组。 ? 缩短长度,切去不必要的片段,增加装载量。 ? 改变复制子,由严紧变为松弛型,以增加拷贝数。 ? 加装特殊的基因元件。 (5) 质粒的分类 ? 多拷贝质粒:用于扩增外源基因。 ? 测序质粒:加装测定顺序所必需的序列。 ? 整合质粒:装有整合促进基因及整合特异序列。 ? 穿梭质粒:能在两种不同的受体细胞中复制。 ? 表达质粒:装有强的启动基因。 ? 探针质粒: 筛选克隆或寻找基因元件。 四、常用的载体 (6) 实验室常用质粒 ? pBR322 4.3kb多拷贝松弛型,内含一个(Ori)、一个抗氨 苄青霉素(Ampr )和一个抗四环素(Tetr )标 记基因。 四、常用的载体 ? pUC18/19 2.8kb,含一个复制起点(Ori)、一个抗性基因Ampr ,一个改造的大肠杆菌β-半乳糖苷酶基因lacZ/,在lacZ/ 基因中有一段人工合成的含多种内切酶的单一切点,在此位点上插入外源DNA都能灭活下游lacZ/基因。 四、常用的载体 DNA的损伤原因: 1.DNA分子的自发性损伤 (1) DNA复制中的错误 (2) DNA的自发性化学变化 a.碱基的异构互变 b.碱基的脱氨基作用 c.脱嘌呤与脱嘧啶 d.碱基修饰与链断裂 2.物理因素引起的DNA损伤 (1) 紫外线引起的DNA损伤 (2) 电离辐射引起的DNA损伤 a.碱基变化 b.脱氧核糖变化、 c.DNA链断裂 d.交联 复习 3.化学因素引起的DNA损伤 (1) 烷化剂对DNA的损伤 a.碱基烷基化 b.碱基脱落 c.断链 d.交联 (2)碱基类似物、修饰剂对DNA的损伤 复习 分子改变类型: 点突变 (point mutation) : 指 DNA 分子上一个碱基的变异(置换)。 (1)、转换 (transition) :发生在同型碱基之间的置换 (2)、颠换 (transversion) :发生在异型碱基之间的置换 突变效应: 同义突变 错义突变 无义突变 终止密码突变 抑制基因突变 移码突变 DNA的修复系统 (一)回复修复 1.光修复 2.单链断裂的重接 3.碱基的直接插入 4.烷基的转移 (二)切除修复(excision repair) (三)重组修复(recombinational repair) (四)SOS修复 复习 1. 转座子的分类和结构特征 a. 简单转座子 转座子(transposon,Tn)是存在于染色体DNA上可自主复制和移位的基本单位。 最简单的转座子不含有任何宿主基因而常被称为插入序列(insertion sequence,IS),它们是细菌染色体或质粒DNA的正常组成部分。一个细菌细胞常带有少于10个IS序列。转座子常常被定位到特定的基因中,造成该基因突变。IS序列都是可以独立存在的单元,带有介导自身移动的蛋白。 b.复合式转座子(composite transposon)是一类带有某些抗药性基因(或其他宿主基因)的转座子,其两翼往往是两个相同或高度同源的IS序列,表明IS序列插入到某个功能基因两端时就可能产生复合转座子。一
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