Chapter 3 Protein Primary Structure 课件.ppt

体内存在多种重要的生物活性肽 谷胱甘肽(glutathione, GSH) The tertiary structure refers to the spatial relationship among all amino acid residues in a polypeptide chain, that is, the complete three-dimensional structure. 3o: 多肽链借助各种非共价键弯曲折叠而形成在空间上的相互关系, 一般球状构象(最低的表面积/体积之比,使蛋白质和周末环境的相互作用力最小) The quaternary structure refers to the spatial arrangements of each subunit in a multisubunit protein, including nature of their contact. 4o: 多亚基的蛋白,各亚基之间在空间上的相互关系和结合方式 * Chapter 3 Protein: Primary Structure Proteins: polymers of amino acids 单体蛋白质(monomeric protein) 寡聚蛋白质(oligomeric protein) 多聚蛋白质(multimeric protein) 亚基 (subunit) amino acids peptides protein Formation of Peptide peptide bond 肽键（酰胺键） 肽是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。 两分子氨基酸缩合形成二肽（dipeptide），三分子氨基酸缩合则形成三肽（tripeptide）…… 肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团不全，被称为氨基酸残基(residue)。 由二十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡肽(oligopeptide)，由更多的氨基酸相连形成的肽称多肽(polypeptide)。 肽键是由一个氨基酸的a-羧基和另一个氨基酸（含侧链）的a-氨基除去一分子水缩合而形成。 serylglycyltyrosylalanylleucine, or Ser–Gly–Tyr–Ala–Leu S–G–Y–A–L N 末端：多肽链中有游离α-氨基的一端 C 末端：多肽链中有游离α-羧基的一端 多肽链有方向性： N末端 C末端 多肽链的主链(backbone) ——N —— Ca —— C —— 肽基(peptide group)或肽单位(peptide unit) ——CO ——NH —— 蛋白质分子量的估算： 20种氨基酸的平均分子量为138 但多数蛋白质中，较小的氨基酸占优势，统计结果为氨基酸的平均分子量接近128，减去一分子水(Mr 18) ，因此氨基酸残基的平均分子量为110 蛋白质分子量=氨基酸残基数X110 肽平面(peptide plane) 蛋白质的分子结构包括: 一级结构(primary structure) 二级结构(secondary structure) 三级结构(tertiary structure) 四级结构(quaternary structure) The primary structure is the amino acid sequence (including the locations of disulfide bonds). 1o: 多肽链的氨基酸顺序 The secondary structure refers to the regular, recurring arrangements of adjacent residues resulting mainly from hydrogen bonding between backbone groups, with a-helices and b-pleated sheets as the two most common ones. 2o: 多肽链按氢键排列成有规律的a螺旋和b折叠片段 蛋白质序列的测定 确定蛋白质中不同肽链的数目----末端分析 拆分多肽链 断裂多肽链内的二硫键 分析多肽链的氨基酸组成 确定多肽链N-末端或C-末端残基 裂解多肽链成为较小的片断 测定各多肽段的氨基酸序列 重建完整多肽链的氨基酸序列 确定二硫键的位置 蛋白质测序的常用方法 （一）末端分析 Frederi