棘头梅童鱼线粒体控制区的序列变异与群体遗传结构 mtDNA control region sequence variation and genetic structure of Collichtys iucidus populations.pdfVIP

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棘头梅童鱼线粒体控制区的序列变异与群体遗传结构 mtDNA control region sequence variation and genetic structure of Collichtys iucidus populations

第32卷第2期 渔业科学进展 V01.32,No.2 2 01 1 年4月 PROGRESSINFISHERYSCIENCES Apr.,2011 棘头梅童鱼线粒体控制区的序列变异与群体遗传结构 郑德锋1 赵金良¨ 周文玉2 (1农业部水产种质资源与利用重点开放实验室上海海洋大学,201306) (2上海市水产研究所,200433) 摘要 采用PCR扩增测序法获得了棘头梅童鱼Collichtysiucidus南通、启东、芦潮港、温州、瑞 安、福州、番禺7个地理群体53尾鱼的mtDNA控制区全序列。棘头梅童鱼控制区序列长度为778~ 782 bp,序列长度变异主要是由位点的插入或缺失造成,识别了终止序列区TAS和保守序列区 7±0.017 5±0.002 单倍型多样性(Hd)为0.934 5,平均核苷酸多样性(丌)为0.017 3。棘头梅童鱼群 7~0.022 3~0.043 体内的遗传距离(K2一P)为0.001 8,群体间的遗传距离为0.002 3,群体间的分化 4~0.845 指数FST为一0.058 亲缘关系树显示,棘头梅童鱼7个群体分为两个大支,一支以北方类群(南通、启东、芦潮港、温州群 体)个体为主,另一支以南方类群(福州和番禹群体)个体为主,而位于南、北方类群中间位置的瑞安群 体则与两大类群均有交叉。 关键词 棘头梅童鱼 群体遗传结构 线粒体控制区 序列 中图分类号$931.5 文献识别码A 文章编号 1000—7075(2011)02—0034—07 mtDNA control variationand structure region sequence genetic of iucidus Collichtyspopulations ZHENG ZHAO ZHOU De—fen91 Jin—lian91’ Wen—yu2 (1 of GeneticResourcesand of Ocean KeyLaboratoryAquatic Utilization,MinistryAgriculture,Shanghai (2 FisheriesResearchInstitute。200433) Shanghai ABSTRACTThe ofmitochondrialcontrol of53individualsofCollich— completesequences region iucidusfromseven tys (WZ),Ruian(RA),Fuzhou(FZ),andobtainedPCR Panyu(PY)wereby cloning.Sequencelengths the iucidus of control ofC variedinthe of778—782 was causedthe

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