医学论文-亚洲带绦虫烯醇酶基因及其蛋白质的结构与功能.docVIP

医学论文-亚洲带绦虫烯醇酶基因及其蛋白质的结构与功能 【摘要】? 分析和预测亚洲带绦虫烯醇酶基因及其编码蛋白的结构和特性，用于指导其生物学功能的实验研究。【方法】 利用美国国家生物技术信息中心和瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统中有关基因和蛋白的序列和结构信息分析的各种工具，结合其他生物信息学分析软件包，如Ｐｃｇｅｎｅ和Ｖｅｃｔｏｒ ＮＴＩ ｓｕｉｔｅ， 从亚洲带绦虫全长ｃＤＮＡ质粒文库中识别烯醇酶基因及其编码区，分析、预测该基因编码的蛋白质的理化特性、翻译后的修饰位点、功能域、亚细胞定位、拓扑结构、二级结构、三维空间构象等。【结果】 该基因全长１７３７ ｂｐ，编码区为第２０５～１５０３ ｂｐ，编码４３３个氨基酸，为全长基因。ＧｅｎＢａｎｋ中与棘口吸虫烯醇酶氨基酸序列同源性最高，达７８％。相对分子量理论预测值为４６６５３．５ Ｋｕ。没有质体、线粒体定位序列。预测编码蛋白有１个跨膜区，３个亲水性部位。与吸虫属的烯醇酶进化关系最近。 【结论】 应用生物信息方法从亚洲带绦虫成虫ｃＤＮＡ文库中筛选出了亚洲带绦虫烯醇酶ｃＤＮＡ全长序列并预测得到其结构与功能方面信息。 【关键词】? 亚洲带绦虫 烯醇酶 结构 能 生物信息学 　　Ａｂｓｔｒａｃｔ： 【Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ】 Ｔｏ ｇｅｔ ｔｈｅ ｍｅｓｓａｇｅｓ ｏｎ ｔｈｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ ａｎｄ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｅｎｏｌａｓｅ ｆｒｏｍ Ｔａｅｎｉａ ａｓｉａｔｉｃａ（Ｔ．ａ．ＥＮＯ） ｂｙ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ． 【Ｍｅｔｈｏｄｓ】 Ａ ｆｕｌｌ-ｌｅｎｇｔｈ ｃＤＮＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｅｎｃｏｄｉｎｇ ｅｎｏｌａｓｅ ｆｒｏｍ ｃＤＮＡ ｐｌａｓｍｉｄ ｌｉｂｒａｒｙ ｏｆ Ｔａｅｎｉａ ａｓｉａｔｉｃａ ｗａｓ ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ ｂｙ ｕｓｉｎｇ ｔｏｏｌｓ ｏｆ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ａｔ ｗｅｂｓ ｓｉｔｅｓ ｏｆ ＮＣＢＩ． Ｔｈｅ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｔｈｅ ｄｅｄｕｃｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎ ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ｔｈｅ ｐｈｙｓｉｃｏ-ｃｈｅｍｉｃａｌ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ， ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｓｉｔｅｓ ａｆｔｅｒ ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ， ｄｏｍａｉｎｓ， ｓｕｂｃｅｌｌｕａｒ ｌｏｃａｔｉｏｎ， ｔｏｐｏｌｏｇｉｃａｌ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ， ｓｅｃｏｎｄａｒｙ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ， ａｎｄ ３Ｄ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｗｅｒｅ ｐｒｅｄｉｃｔｅｄ ｂｙ ｅｍｐｌｏｙｉｎｇ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ｓｏｆｔｗａｒｅ ｐａｃｋａｇｅ ｓｕｐｐｌｉｅｄ ｂｙ ｔｈｅ ｗｅｂｓｉｔｅ ｏｆ ＥｘＰａＳｙ． 【Ｒｅｓｕｌｔｓ】 Ｔｈｅ ｆｕｌｌ ｃＤＮＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｅｎｃｏｄｉｎｇ Ｔ．ａ．ＥＮＯ ｉｎｃｌｕｄｅｓ ａ ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｏｐｅｎ ｒｅａｄｉｎｇ ｆｒａｍｅ ｏｆ １２９９ｂｐ ｗｈｉｃｈ ｅｎｃｏｄｅｄ ａ ｐｕｔａｔｉｖｅ ｐｒｏｔｅｉｎ ｏｆ ４３３ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄｓ． Ｔｈｅ ｃｏｄｉｎｇ ｒｅｇｉｏｎ ｉｓ ２０５ ｂｐ ～ １５０３ ｂｐ． Ｔｈｅ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄｓ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｈａｓ ａ ｈｉｇｈ ｉｄｅｎｔｉｔｙ ｗｉｔｈ ｅｎｏｌａｓｅ ｆｒｏｍ ｏｔｈｅｒ ｓｐｅｃｉｅｓ ｉｎ ＧｅｎＢａｎｋ． Ｔｈｅ ｐｒｏｔｅｉｎ ｈａｓ ｏｎｅ ｔｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅ ｒｅｇｉｏｎ ａｎｄ ｓｔａｂｌｅ ｐｈｙｓｉｃｏ-ｃｈｅｍｉｃａｌ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ． Ｔｈｅ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｗｅｉｇｈｔ ｏｆ Ｔ．ａ．ＥＮＯ ｉｓ ｐｒｅｄｉｃｔｅｄ ｔｏ ｂｅ ４６６５３．５ｕ． Ｔｈｅ ｐｒｏｔｅｉｎ ｈａｓ ｔｈｒｅｅ ｈｙｄｒｏｐｈｉｌｉｃ ｒｅｇｉｏｎｓ． Ｔｈｅ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ｏｆ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｓｉｓ ｂｅｔｗｅｅｎ Ｔ．ａ．ＥＮＯ ａｎｄ ｅｎｏｌａｓｅ ｏｆ ｏｔｈｅｒ ｔｒｅｍａｔｏｄｅｓ ｉｓ ｃｌｏｓｅ． 【Ｃｏｎｃｌｕｓｉｏｎ】 Ｔｈｅ ｃＤＮＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｅｎｃｏｄｉｎｇ ｅｎｏｌａｓｅ ｗａｓ ｓｃｒｅｅｎｅｄ ｆｒｏｍ ｃＤＮＡ ｌｉｂｒａｒｙ ｏｆ ａｄｕｌｔ Ｔａｅｎｉａ ａｓｉａｔｉｃａ ｂｙ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ． Ｔｈｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｔｈｅ ｇｅｎｅ ａｎｄ ｐｒｏｔｅｉｎ ｏｆ Ｔ．ａ．ＥＮＯ ｗｅｒｅ ｏｂｔａｉｎｅｄ． 　　Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ：Ｔａｅｎｉａ ａｓｉａｔｉｃａ； Ｅｎｏｌａｓｅ； ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ； ｆｕｎｃｔｉｏｎ；ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ 　　亚洲带绦虫（Ｔａｅｎｉ