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实时荧光定量PCR技术培训;(一)实时荧光定量PCR原理和应用;PCR
定量PCR
荧光化学监测物质
实时荧光定量PCR应用; 多聚酶链式反应(polymerase chain reaction)简称PCR技术,是80年代中期发展起来的一种体外扩增特异DNA片段的技术。此法操作简便, 可在短时间内在试管中获得数百万个特异的目的DNA序列的拷贝。
PCR技术实际上是在模板DNA, 引物和4种脱氧核苷酸存在的条件下依赖于DNA聚合酶的酶促合反应,PCR技术的特异性取决于引 物 和 模 板 D N A 结 合 的 特 异 性 。 反 应 分 三 步 : ① 变 性(denaturation);②退火(annealing);③延伸(ex tension),反应过程见图。;定量 PCR 技术(real-time PCR),是指在 PCR 反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号累积实时监测整个 PCR 进程,最后通过特定数学原理对未知模板进行定量分析的方法。; 荧光定量 PCR 所使用的荧光化学可分为两种:荧光探针和荧光染料。
荧光定量 PCR 最常用的方法是 DNA 结合染料 SYBR GreenⅠ的非特异性方法和 Taqman 水解探针的特异性方法,;SYBR Green I 的优点: 实验设计简单,仅需要设计上下游一对引物,不需
要设计探针,无需设计多个探针即可快速检验多个基因,通用性好;成本低;能
够通过溶解曲线分析检验扩增产物的特异性。因而在低通量实验和单重实验时一
般优先考虑使用 SYBR Green I 染料法。
SYBR Green I 的缺点:由于 SYBR Green I 与所有的双链 DNA 相结合,
因此由引物二聚体、单链二级结构以及错误的扩增产物引起的假阳性会影响定量
的精确性,SYBR Green I 方法对 PCR 扩增特异性要求较高。实验过程中通过熔
解曲线来分析产物的均一性有助于分析由 SYBR Green I 得到定量结果。另外,
因为 SYBR Green I 不能区分不同扩增子发出的荧光而导致它不能用于多重反
应。 ; 实验技术路线图;(二)实时荧光定量PCR实验设计;实验要素;样品;标准品; 标准品制作流程;梯度稀释方法;引物;好的引物;优化步骤;扩增效率;阴性对照:基因组对照;看家基因的选择标准;重复;实验中考虑因素;避免污染;(三)实时荧光定量PCR实验结果分析;1)绝对定量:测定未知样品的绝对量,??给定的血样中的病毒颗粒数,食品中某一种转基因成分的含量;
2)相对定量:未知样品与已知样品相比,基因的表达量改变了多少倍:如相当量的肿瘤组织和正常组织相比,p53mRNA 改变了多少倍。
绝对定量是通过样品的 Ct 值和标准曲线进行比较实现的。分析的结果是给定数量的样品中(给定数量的细胞,每微克总 RNA)中核酸的量(拷贝数、微克)。
相对定量的分析结果是在相当量的试验组(样品 A)和对照组(样品 B)中一个靶基因的相对比率(倍数差异)。;绝对定量与相对定量;绝对定量:标准品;相对定量;相对定量数据处理;相对定量:双标准曲线法;Thanks for your attention
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