[医学]测序和片段分析故障排除.pdf

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[医学]测序和片段分析故障排除

DNA测序与片段分析 故障排除 DNA测序和片段分析故障排除 预防的要点成功的关键 质粒测序 模板: 引物= 200 ng : 3.2 pmol 保持BigDye的终浓度为1x PCR产物测序 模板: 引物= 10 ng : 3.2 pmol 测序前一定要酒精沉淀纯化 2 © 2006 Applied Biosystems DNA测序和片段分析故障排除 提供线索的软件界面 3 © 2006 Applied Biosystems DNA测序和片段分析故障排除 电泳图谱(Electropherogram)窗口 峰形是否正常 有无杂带 信噪比 测序长度 4 © 2006 Applied Biosystems DNA测序和片段分析故障排除 原始数据(raw )窗口 平均信号高度:正常范围150-1500点;100说明测序反应失败 峰有无变宽 左右峰高是否均衡 5 © 2006 Applied Biosystems DNA测序和片段分析故障排除 信息(Annotation/information )窗口 SeqAnalysis 3.7 (3100) SeqAnalysis 5.1 (3730) 6 © 2006 Applied Biosystems DNA测序和片段分析故障排除 仪器状态(EPT)窗口 电流是否平稳:放电、气泡 过高、过低:缓冲液、气温 7 © 2006 Applied Biosystems DNA测序和片段分析故障排除 引物的影响 8 © 2006 Applied Biosystems DNA测序和片段分析故障排除 引物合成缺陷 合成时 合成时 部分引物多一个碱基 部分引物少一个碱基 9 © 2006 Applied Biosystems DNA测序和片段分析故障排除 模板上没有引物结合位点 10 ©

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