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[生物学]分子生物学2染色体和DNA
分子生物学 第二章染色体和DNA 染色体 DNA的结构 DNA的复制 DNA的修复 DNA的转座 染色质(chromatin):是细胞间期核内伸展开的、能被硷性染料着色的DNA蛋白质纤维。 染色体(chromosome):细胞分裂期形成的高度螺旋化的染色质。 (中期) (三)染色质的结构及染色体组装 四级结构:染色体 超螺线管再进一步折迭和缠绕形成的染色体。 3、DNA的高级结构(三级结构) 1)定义:指DNA双螺旋进一步扭曲盘绕所形成的特定空间结构。是一种比双螺旋更高层次的空间构象。 环状DNA形成的超螺旋 真核生物中的DNA聚合酶 α β γ δ ε 定位 细胞核 细胞核 线粒体 细胞核 细胞核 3‘-5’外切 - - + + + 功能 双链的解开 RNA引物的合成 DNA链的延伸 切除RNA引物,填补缺口,连接相邻的DNA片段 在DNA聚合酶III的作用下,进行半不连续复制(semi-discontinuous replication) DNA复制时其中一条子链的合成是连续的,而一条子链的合成是不连续的,故称半不连续复制。 1、θ型复制:双向等速 (1)模板链和新合成的链分开; (2)不需RNA引物,在正链3‘-OH上延伸 (3)只有一个复制叉。 3、D环复制 根据母链甲基化原则找出错配碱基的示意图 甲基化指导的错配修复示意图 2、碱基切除修复 胞嘧啶去氨基生成尿嘧啶 3、核苷酸切除修复(最普遍) 五、 DNA的转座 (一)基本概念: (二)转座子的类型和结构特征 2、复合转座子(composite transposon) 复合转座子是一类带有某些抗药性基因(或其他宿主基因)的转座子,其两翼往往是两个相同或高度同源的IS序列。 8、核小体是由H2A、H2B、H3、H4各两个分子生成的( )和由大约200bp DNA组成的。八聚体在中间,DNA分子盘绕在外,而( )则在核小体的外面。 单向复制的特殊方式 如:动物线粒体DNA 复制起始点不在双链 的同一位置,内外环 复制时有时序的差异。 (五)真核细胞的DNA复制 与原核细胞复制不同点: 1、多起点复制: 1个DNA有100-1000复制起点。 2、DNA 链延伸速度慢。 3、RNA引物、冈崎片断小: 真核:10bp, 100-200bp 原核:10-60bp, 1000-2000bp 4、所需的酶不同(多种酶) 5、复制完成前不能开始下一轮复制 基本过程与原核细胞相似。 6、 与细胞分裂密切相关 四、DNA的修复 修复嘧啶二体或甲基化DNA DNA直接修复 修复被破坏的DNA 核甘酸切除修复 切除突变的碱基 碱基切除修复 恢复错配 错配修复 功能 DNA修复系统 维持遗传物质的稳定。 (一)、错配修复(复制后修复) 错配修复(mismatch??repair,??MMR)系统: 错配矫正酶(MutS、L、H)、DNA聚合酶III、 DNA外切酶和DNA连 接酶等11种蛋白和酶。 1、Dam甲基化酶使母链位于5’GATC序列中腺甘酸甲基化(甲基化紧随在DNA复制之后); 2、错配修复系统根据甲基化识别母链和子链,切除尚未甲基化的子链上的错配碱基,并进行修复。 机理: 修复过程: 1、启始:识别错配区域 、发现错配碱基 2、切除:切开非甲基化子链,由核酸外切酶将距离GATC到错配 区域间的DNA链切除。 3、修复:由DNA聚合酶Ⅲ全酶进行合成,连接酶对缺口进行连接。 在水解ATP的作用下,MutS, MutL与碱基错配点的DNA双链结合 MutS-MutL在DNA双链上移动,发现甲基化DNA后由MutH切开非甲基化的子链 错配碱基位于切口3’下游端, 错配碱基位于切口5’上游端, 外切酶VII or RecJ切除 外切酶 I or X切除 切除后,SSB,Pol III、DNA 连接酶,填补切口 一些碱基在自发或诱变下会发生脱酰胺,然后改变配对性质,造成碱基转换突变。 腺嘌呤变为次黄嘌呤与胞嘧啶配对 鸟嘌呤变为黄嘌呤与胞嘧啶配对 胞嘧啶变为尿嘧啶与腺嘌呤配对 细胞内存在特异的糖甘水解酶,能识别改变了的碱基,把碱基从N-β-糖苷键处切下来,然后在一些相关酶的
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