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实验一IEF/SDS—聚丙烯酰胺凝胶双向电泳; 随着人类基因组计划的实施和推进,生命科学研究已进入
了后基因组时代在这个时代,生命科学的主要研究对象是功能
基因组学,包括结构基因组研究和蛋白质组研究等。自从澳大
利亚学者Wilkins和Williams等人于1994年提出蛋白质组
(Proteome)这一概念以来,国际上蛋白质组研究进展十分迅速,
不论基础理论还是技术方法,都在不断进步和完善。相当多种细
胞的蛋白质组数据库已经建立,相应的国际互联网站也层出不
穷。1996年,澳大利亚建立了世界上第一个蛋白质组研究中
心:Australia Proteome AnalysisFacility(APAF)。丹麦、加
拿大、日本也先后成立了蛋白质组研究中心。在美国,各大药厂
和公司在巨大财力的支持下,也纷纷加入蛋白质组的研究阵容。; 国内从1997年开始开展蛋白质组研究,已建立起基本蛋白
质组平台技术的有中国科学院上海生命科学研究院蛋白质组研
究中心和军事医学科学院。目前年我国的蛋白质组研究进入了
一个迅速发展的新阶段,其主要标志是国家科技部将蛋白质组研
究确立为“973”和“863”的项目。
蛋白质组学一经出现,就有两种研究策略。一种可称为“竭
泽法”,即采用高通量的蛋白质组研究技术分析生物体内尽可能
多乃至接近所有的蛋白质,这种观点从大规模、系统性的角度来
看待蛋白质组学,也更符合蛋白质组学的本质。但是,由于蛋白
质表达随空间和时间不断变化,要分析生物体内所有的蛋白质是
一个难以实现的目标。另一种策略可称为“功能法”,即研究不同
时期细胞蛋白质组成的变化,如蛋白质在不同环境下的差异表达,
以发现有差异的蛋白质种类为主要目标。这种观点更倾向于把
蛋白质组学作为研究生命现象的手段和方法。;一、实验原理
聚丙烯酰胺双向电泳是一种由任意两个单向聚丙烯酰胺
电泳组合而成的,在第一向电泳后再与第一向垂直的方向上
进行第二向电泳的分离方法。其基本原理是第一项基于蛋白
质的等电点不同在pH梯度胶内等电聚焦(Isoelectricfocusing );
第二项则根据分子量的不同大小进行SDS-PAGE分离,把
复杂蛋白质混合物中的蛋白质在二维平面上分开。经过电??和
质量两次分离后,可以得到蛋白质分子的等电点和分子量
信息。
;二. 实验步骤; 2) 第一向凝胶储备液(含28.38%丙烯酰胺、1.62%甲叉双
丙烯酰胺):取7.09g丙烯酰胺溶于双蒸水后加入0.405g甲叉双
丙烯酰胺。待溶解完全后定容至25ml,置于棕色瓶内于, 4℃冰
箱保存。
3) 第一向电极母液(临用前稀释10倍):
正电极母液(0.1mol磷酸):取6.75ml磷酸,用去离子水定
容至1000ml。
负电极母掖(0.2mol NaOH):取16g NaOH,用去离子水定容
至2000ml。
4)样品覆盖掖(含8.0mol/L尿素、0.4% Ampholine pH5-
7、0.4% Ampholine pH6-8、0.4% Ampholine pH3.5-10、5
mmol/L K2CO3):取新鲜尿素4.8g,0.1ml Ampholine pH5-7,
0.1ml Ampholine pH6-8,0.1mlAmpholine pH3.5-10,1ml 50
mmol/L K2CO3,用双蒸水定容到10ml。用Eppendorf 管分装,
每管100ul,置于-20℃冰箱保存。; 5)平衡液(含10%甘油、5%?-巯基乙醇、2.3g SDS 、0.625mol /LTris-
HCI、55ml甲醇):取10ml甘油、5ml ?-巯基乙醇、0.5ml浓盐酸、2.3g
SDS、0.757gTris,先用20ml双蒸水溶解,然后加入55ml甲醇,最后用双蒸水
定容到100ml。置棕色瓶中于4℃冰箱保存。
6)第二向凝胶储备液(丙烯酰胺:甲叉双丙烯酰胺=29:1):取29g丙烯
酰胺溶于双蒸水后加入1g甲叉双丙烯酰胺,待溶解完全后定容至100ml,置于
棕色瓶内于4℃冰箱保存。
7)分离胶缓冲液(1.5mol Tris-HCI,pH8.8):取0.86gTris,溶于
400ml双蒸水中,用浓盐酸调pH到8.8,最后定容至500ml。
8)浓缩胶缓冲液(1.0mol Tris-HCI,pH6.8):取0.56gTris,溶于
400ml双蒸水中,用浓盐酸调pH到6.8,最后定容至500ml。
9)SDS电极贮存液(临用前稀释5倍):900ml去离子水中溶解
15.1g Tris和94g甘氨酸,然后加入50ml 10%(w/v)的电泳级SDS贮存液,用
去离子水定容至1
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