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生物信息学导论Introduction to Bioinformatics;课程安排 1、时间：每周二晚11～12节（19:10~21:00） 教室：一教208教室 学时：每周2学时（总计16?2=32学时） 2、学分：2学分 3、成绩考核方式（无笔试）： 1次调研报告（分2次在课堂讨论），占总成绩50％ 1次学习研究论文（期末完成），占总成绩40％ 其它占总成绩10％ 4、E-mail: hqzhu@ Tel:6276 7261(office) （办公室地址：力学系力学楼503室） 5、课程大纲和讲义可在北大理论生物学中心网站下载。 （/main/Course.htm）;参考资料 Westhead et al., Bioinformatics（英文原版），科学出版社，2003年 Pevzner，Computational Molecular Biology，MIT Press，2000 Salzberg, et al., Computational Methods in Molecular Biology, Elsevier Science, 1998 Waterman, Introduction to Computational Biology, Chapman Hall, 1995 Durbin等, Biological sequence analysis（英文原版）, 清华大学出版社，2002 Brown著，袁建刚等译，基因组，科学出版社，2002年 Campbell等著，孙之荣等译，探索基因组学、蛋白质组学和生物信息学，科学出版社，2004年 郝柏林、张淑誉，生物信息学手册（第二版），上海科学技术出版社，2002年 Attwood等著，罗静初等译，生物信息学概论，北京大学出版社，2002年 Mount，Bioinformatics—Sequence and Genome Analysis，科学出版社，2002年（中文版由钟杨等译、高等教育出版社2003年出版）;第一章 前 言;生命活动三要素：物质、能量、信息; 基因组(Genome)：包含细胞或生物体的全套遗传信息的全 部遗传物质 原核生物(细菌、病毒等) 真核生物(真菌、植物、动物等);1984.12 犹他州阿尔塔组织会议，初步研讨测定人类整个基 因组DNA序列的意义 1985 Dulbecco在《Science》撰文 “肿瘤研究的转折点:人 类基因组的测序” 美国能源部(DOE)提出“人类基因组计划”草案 1987 美国能源部和国家卫生研究院（NIH）联合为“人类 基因组计划”下拨启动经费约550万美元 1989 美国成立“国家人类基因组研究中心”，Watson担任 第一任主任 1990.10 经美国国会批准，人类基因组计划正式启动;尽管比之于人类登月，HGP的投入资金要少得多，但HGP对人类生活的影响要更为深远。因为随着这个计划的完成，DNA分子中编码的遗传信息将对人类存在的化学基础作出最终的回答。这将不仅帮助我们理解我们是如何作为健康的人发挥正常功能的，而且也将在化学水平上解释遗传因子在各种疾病，如癌症、早老痴呆症、精神分裂症等一些严重危害人类健康的疾病中的作用。毕竟对人类自身更深入的了解是人类活动中最重要的一个部分。 ——Watson ,1990,《Science》;HGP的最初目标通过国际合作，用15年时间(1990～2005)至少投入30亿美元，构建详细的人类基因组遗传图和物理图，确定人类DNA的全部核苷酸序列，定位约10万基因，并对其它生物进行类似研究。 4张图：遗传图 物理图 序列图 基因图 HGP的终极目标 阐明人类基因组全部DNA序列； 识别基因； 建立储存这些信息的数据库； 开发数据分析工具； 研究HGP实施所带来的伦理、法律和社会问题。 ;1995 第一个自由生物体流感嗜血菌(H. inf)的全基因组测序完成 1996 完成人类基因组计划的遗传作图