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2010 鹰嘴豆EST资源中SSR的信息分析
第 36 卷第 2 期 湖南农业大学学报( 自然科学版) Vol.36 No.2
2010 年 4 月 Journal of Hunan Agricultural University (Natural Sciences) Apr ．2010
DOI:10.3724/SP.J.1238.2010.00137
鹰嘴豆 EST 资源中 SSR 的信息分析
1 1 1 1 2 2 2 2* 1*
王显生 ，贾钰莹 ，顾汉艳 ，何小玲 ，张桦 ，张巨松 ，石书兵 ，李建贵 ，麻浩
(1.南京农业大学 作物遗传与种质创新国家重点实验室，江苏 南京 210095 ；2. 新疆农业大学 农业生物技术重
点实验室, 新疆 乌鲁木齐 830052)
摘 要：从 NCBI 公共数据库下载获得 27 904 条鹰嘴豆表达序列标签 EST ，去除其中低质量的和冗余序列后得
到全长为 6 198 092 bp 的 11 224 条无冗余 EST ．利用SSRIT(Simple sequence repeat identification tool)软件共在这
些序列中发掘出 982 个 SSR ，它们分布于865 条 EST 中，出现频率为 8.69% ，平均长度为15.58 bp ，平均距离为
6.31 kb ．在鹰嘴豆EST-SSR 中，二核苷酸重复是最主要的重复类型(66.90%) ，其次是三核苷酸重复类型(30.75%) ，
出现最多的重复基元类型是 TA/AT(24.95%) ．
关 键 词：鹰嘴豆；表达序列标签-简单重复序列；频率；特性
中图分类号：S529.024 文献标志码：A 文章编号：1007-1032(2010)02-0137-05
Information analysis of EST resource of chickpea
1 1 1 1 2
WANG Xian-sheng , JIA Yu-ying , GU Han-yan , HE Xiao-ling , ZHANG Hua ,
2 2 2* 1*
ZHANG Ju-song , SHI Shu-bing , LI Jian-gui , MA Hao
(1.State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095,
China; 2.Key Laboratory of Agriculture Biotechnology, Xinjiang Agricultural University, Urumqi 830052, China)
Abstract ：27 904 ESTs of chickpea (Cicer arietinum L.) were downloaded from the database of NCBI and some
redundant or
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