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DNA提取完美课件
全血基因组DNA快速提取
试剂盒 (离心柱型)
DNA提取的目的
基因组DNA的制备是基因分析的前提
构建文库;PCR;Southern Blots; RFLP;PFGE
荧光定量PCR;CGH
DNA测序;DNA克隆等
掌握基因组DNA提取的基本方法
DNA提取的原理
独特的结合液/蛋白酶K迅速裂解细胞和灭活细胞内核酸酶,然后基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜, 再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤, 抑制物去除液和漂洗液将细胞代谢物、蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA从硅基质膜上洗脱。
器材与试剂
无水乙醇、灭菌水、恒温水浴箱、1.5ml离心管、常温高速离心机、冰箱、离心管架、移液器、吸头等。
DNA提取的步骤
破碎细胞
提 取
纯 化
操作步骤(以200μl 全血提取举例)
操作前处理:
1、第一次使用前请先在15ml漂洗液WB中加入60ml无水乙醇!
2、此试剂盒中蛋白酶K为冻干粉状,应予以短暂离心后,加入1毫升灭菌水溶解(浓度为20mg/ml),溶解后立即按照每次使用量(20微升)分装冻存,-20℃保存。
3、开始实验前将需要的水浴先预热到70℃备用。
样本前处理:
1.、冻存的抗凝血液使用前溶解应在37℃水浴迅速溶解。
2.、抗凝血提取前需要彻底混匀后再吸取实验所需的体积。
3、 为了最佳效果,最好使用新鲜血液标本或者 4℃存放少于 3 天 的标本,不要使用反复冻融超过3次的标本,否则会严重降低产量。
1、200ul样本放入1.5ml离心管
2、20μl 蛋白酶K溶液,室温15 分钟(期间颠倒混匀几次)
3、200μl 结合液CB,立刻剧烈颠倒轻摇,充分混匀,70℃放置10分钟
如果全血起始量小于200μl,则用缓冲液BB补足到200μl。如果起始量介于200μl-300μl之间,则后续操作需要按照比例增加试剂用量。如果起始量介于300μl-1毫升之间,则需要先进行红细胞裂解操作。
100μl异丙醇(陈旧血加200μl异丙醇),剧烈颠倒轻摇
上述各操作步骤中适当力度充分混匀非常重要,混匀不充分严重降低产量,但不可用手剧烈振荡,以免剪切DNA。
清亮
沉淀
续上
上一步所得溶液和絮状沉淀都加入吸附柱Ⅵ中(吸附柱放入收集管中),10,000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液。
吸附柱Ⅵ
1、500μ l 抑制物去除液IR,12,000rpm 离心30秒,弃废液。
核酸吸附
漂洗去杂
将吸附柱Ⅵ放回空收集管中,13,000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液。
接下
2、加入700μl 漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm离心30秒,弃掉废液。
3、加入500μl 漂洗液WB,12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。
续上
取出吸附柱Ⅵ,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加100μl洗脱缓冲液EB(洗脱缓冲液事先在 65-70℃水浴中预热), 室温放置3-5分钟,12,000 rpm 离心1分钟。
将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,室温放置2分钟,12,000 rpm离心1分钟。
洗脱DNA
(洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要DNA浓度较高,可以适当减少洗脱体积, 但是最小体积不应少于50μl,体积过小降低DNA洗脱效率,减少DNA产量)
DNA 可以存放在2-8℃,如果要长时间存放,可以放置在-20℃
DNA保存
1、DNA在储存前要确保纯化得到的核酸的纯度。
2、纯化得到的基因组DNA最好溶解在 Tris缓冲液(pH8.0)里,因为大片段的 基因组DNA在酸性水溶液中不稳定,易水解。
DNA检测方法
纯度(OD260/OD280)
紫外分光光度计进行测量(选择正确的稀释倍数) OD260/OD280 1.7 说明有蛋白的污染
OD260/OD280 =1.7~1.9 说明纯度很好
OD260/OD280 1.9 说明有部分降解或有RNA污染
得率
紫外分光光度计进行测量
Yield= OD260×50ng/μ L×稀释倍数(双链DNA)
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