生物化学-第一篇 生物大分子的结构与功能.ppt

二、氨基酸的分类（p9-10表1-1） 非极性脂肪族氨基酸：具有非极性R侧链，呈疏水性，包括脂肪族氨基酸。（6种） 极性中性氨基酸：具有极性R侧链，呈亲水性，通常含羟基、巯基、酰胺基等。 （6种） 芳香族氨基酸：含有苯环（3种） 酸性氨基酸：R侧链含羧基（2种） 碱性氨基酸：R侧链含氨基、胍基或咪唑基（3种） 1、肽键： 一个氨基酸的羧基和另一个氨基酸的氨基之间脱去一分子水形成的酰胺键，是蛋白质中氨基酸间最基本的连接方式。 三、蛋白质的三级结构（Tertiary Structure） （一） 整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置，也就是所有原子在三维空间的整体排布，称为三级结构，包括主、侧链构象。 六、蛋白质组学（proteomics） 定义：以细胞内全部蛋白质的存在及其活动方式为研究对象 研究内容：蛋白质表达谱、翻译后修饰谱、亚细胞定位图、相互作用图、生物信息学及数据库 技术平台： 双向电泳 蛋白质点的定位、切取 蛋白质点的质谱分析 研究意义 二、 蛋白质具有胶体性质 1. 有许多高分子溶液的性质（Mr 1万-100万kD，直径1-100nm，为胶粒范围之内），如： 扩散慢 易沉降 粘度大 不能透过半透膜 2. 蛋白质胶体溶液的稳定因素： 水化膜 颗粒表面电荷 三、蛋白质的变性（Denaturation） 在某些物理和化学因素作用下，蛋白质特定的空间构象被破坏，即有序的空间结构变成无序的空间结构，从而导致其理化性质改变和生物活性丧失。 四、蛋白质的紫外吸收特征 离子交换：蛋白质的电荷量及性质不同。 阳离子交换剂：CM-纤维素 阴离子交换剂：DEAE-纤维素 亲和层析：抗原-抗体，配体-受体，金属离子，生物素等 高效液相（HPLC）：反相HPLC，离子HPLC，凝胶过滤HPLC 蛋白质的aa排列顺序的决定 将蛋白质部分水解成为肽段，再逐个鉴定各肽段的aa序列，将各肽段连接起来即可。 　方法：用两种（或以上）不同方法水解蛋白质，因水解部位不同，可得到两系列不同的小肽段，再从两系列中找出关键性的重叠的肽段，即可将肽段连接得到蛋白质序列。 复习题 组成蛋白质的元素有哪几种？其中哪一种的含量可以表示蛋白质的相对含量？ 何谓氨基酸的等电点？酸性和碱性氨基酸的等电点如何计算？ 肽键和肽链； 试述蛋白质一级结构和高级结构的概念及维持各级结构的键和力？ 什么是蛋白质的二级结构，主要有哪几种？ 举例说明蛋白质结构与功能的关系 何谓蛋白质的变性？有何实际重要意义？ 举例说明蛋白质分离纯化方法及其原理。 方法1 方法2 正常红细胞 镰刀形红细胞 肌红蛋白 血红蛋白α 血红蛋白β 二、蛋白质的功能依赖特定空间结构 （一）血红蛋白与肌红蛋白的结构相似 肌红蛋白 血红蛋白 血红素结构 肌红蛋白(Mb)和血红蛋白(Hb)的氧解离曲线 Hb与Mb一样能可逆地与O2结合， Hb与O2结合后称为氧合Hb。氧合Hb占总Hb的百分数（称百分饱和度）随O2浓度变化而改变。 （二）血红蛋白亚基构象变化影响亚基与氧结合 Hb的4个亚基与4个O2结合 的平衡常数不同，第一个亚基结合O2后，可促进其它亚基与O2的结合。 协同效应 90 一个亚基与其配体（Hb中的配体为O2)结合后，能影响此寡聚体中另一个亚基与配体的结合能力，称为协同效应(cooperativity) 。 正协同效应(positive cooperativity)：促进作用 负协同效应(negative cooperativity)：抑制作用 Hb结合氧的理论解释 变构效应 变构剂 变构蛋白 由一个O2与Hb亚基结合后引起亚基的构象变化 变构效应（allosteric effect）：蛋白质分子的特定部位与小分子化合物结合后，引起蛋白质分子空间构象改变，从而促使生物学活性变化的现象。 小分子O2或其它化合物称为变构剂。 Hb或其它构象改变的蛋白质称为变构蛋白。 疯牛病 由朊病毒蛋白(prion protein, PrP)引起的一组人和动物神经退行性病变。 正常的PrP富含α-螺旋，称为PrPc。 PrPc在某种未知蛋白质的作用下可转变成全为β-折叠的PrPsc，从而致病。疾病与核酸无关。 PrPc α-螺旋 PrPsc β-折叠 正常 疯牛病 （三） 蛋白质构象改变引起疾病 朊病毒致病过程中的构象变化示意图 蛋白质构象疾病：错误构象相互聚集，形成抗蛋白水解酶的淀粉样纤维沉淀，产生毒性而致病。 老年痴呆 (Alzheimer’s disease)