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蛋白质的生物合成及其在细胞内的降解精品
使用tmRNA 的反式翻译 真核生物的细胞质翻译系统与细菌翻译系统的差别 核糖体的沉降系数为80S,比原核系统大; mRNA模板的结构差别很大,通常是单顺反子,有帽子和尾巴,但没有SD序列; 转录和翻译在时空上分离,分别发生在细胞核和细胞质,两者不存在偶联关系; 起始tRNA不进行甲酰化,也不能进行甲酰化; 只能使用AUG为起始密码子,而且识别起始密码子的机制也完全不同; 起始阶段不仅消耗GTP,还消耗ATP; 起始因子的种类和结构更为复杂; 肽链延伸的速度低于细菌,大概是每秒钟参入2个氨基酸; 只有2种释放因子; 对抑制剂的敏感性不同。 真核生物的细胞质翻译系统翻译的详细机制 氨基酸的活化——此阶段的反应与细菌翻译系统没有什么差别,所不同的是起始氨酰-tRNA并不进行甲酰化。 起始——与细菌差别较大 延伸——与细菌非常相似 eEF-1 代替 EF-Tu和EF-Ts eEF-2 代替 EF-G 终止与释放——与细菌相似,但没有RRF 真核生物的翻译的起始 mRNA的准备和检查 Met-tRNAiMet与核糖体40S小亚基的结合 43S预起始复合物与mRNA复合物结合通过扫描发现起始密码子 60S 亚基的结合与起始因子的释放 mRNA的准备和检查 由于真核系统的mRNA要经历复杂的后加工,所以翻译系统首先需要对mRNA进行检查,以确保只有加工完好的mRNA才能被用作模板。参与这一步反应的起始因子为eIF4系列,其中eIF4E为帽子结合蛋白,专门与mRNA的5端的帽子结合,eIF4G是一种接头分子,既能与eIF4E结合,又能与结合在3端尾巴上的PABP结合,还能结合eIF3,使mRNA的5和3端在空间上相互靠近成环。 mRNA的环化能很好地解释poly A尾巴为什么能提高翻译的效率:一旦核糖体完成翻译通过polyA成环的mRNA,新释放的核糖体亚基所处的位置恰到好处,非常适合在同一个mRNA分子上重新启动翻译。在哺乳动物中,PABP结合到一种可以与eIF4A结合的mRNA结合蛋白——PAIP-1上,加强mRNA的5′端和3′端相互作用,有助于核糖体识别并结合到mRNA的5′端。一些翻译调控因子可以直接结合到mRNA的3′-UTR,与其它翻译起始因子或者40S核糖体亚基相互作用,干扰mRNA 5′-端和3′端的相互作用,阻止或者减缓mRNA的翻译。 真核生物mRNA成环模型 “扫描模型” 40S小亚基首先识别帽子结构,然后沿着mRNA“迁移”,这个过程中核糖体可以解开稳定性小于126 kJ的二级结构,但是稳定性更高的发夹结构则可以阻止核糖体的迁移。当核糖体迁移到起始密码子AUG的地方就停止迁移,通常以遇到的第一个AUG为起始密码子,但是AUG本身并不足以阻止迁移,AUG必须在一个适当的环境中才能被有效识别,其中最重要的是-4位和+1位的碱基,在序列NNNPuNNAUGG中的起始密码子可以被有效识别,在AUG之前第3位的嘌呤,以及紧跟着AUG的G,都可以影响翻译效率达10倍以上。如果引导序列比较长,在第一个40S亚基离开起始位点之前,另一个40S亚基可以识别mRNA的5′-端,从而在引导序列到起始密码子之间结合多个核糖体亚基。 真核翻译系统发现起始密码子的扫描机制 Met-tRNAiMet与核糖体40S小亚基的结合 真核生物mRNA的质量控制 细胞内的mRNA并不总是正常的,基因突变、转录错误或后加工异常等因素会导致一个mRNA分子在原来的ORF内提前出现终止密码子(PTC)或者没有终止密码子,这些异常的mRNA翻译出来的蛋白质可能无功能,甚至有害于细胞。为了及时清除异常mRNA可能产生的危害,真核细胞已经进化和发展出两套高度保守的mRNA质量控制,来处理这些异常的mRNA: 无义介导的mRNA降解机制(NMD)——专门处理含有PTC的mRNA; 无终止mRNA降解(NSD)——专门处理无终止密码子的mRNA。 真核细胞无终止mRNA的降解 古菌的翻译系统 古菌的翻译与真核生物也十分相似。这表现在以下几个方面:(1)核糖体大小与细菌一样,但构成核糖体的rRNA和蛋白质与真核生物的亲缘关系更密切。(2)参与翻译各个阶段的辅助蛋白质因子的数目以及结构的同源性接近真核生物,但各种因子的组成倾向于由单个亚基组成,而不像真核生物由多个亚基组成。在翻译终止阶段,细菌需要RRF,但古菌和真核生物都不需要RRF。(3)第一个参入的氨基酸和真核生物一样,都是甲硫氨酸,而不是细菌的甲酰甲硫氨酸。(4)对抑制剂,特别是对抗生素的敏感性相似。 然而,古菌的翻译系统与细菌也有某些特征很相似。例如:没有5.8S rRNA,mRNA无帽子结构,多为多顺反子,有SD序列,翻译与转录是偶联的。 翻译的抑制剂 细菌翻译系统的抑制剂:大多数是人们熟悉的抗生素
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