微卫星标记品种鉴定.pptVIP

两种方法均较简便 少量标记具有强鉴别能力 12个标记，品种鉴别能力 ? 99.9% 分辨率：非变性PAGE明显较高 选用非变性PAGE 推荐采用的检测方法 初步打算 数据库构建：12+12 每条染色体2个，距离不能太近 主要考虑因素 品种内变异；近缘材料（如姐妹系） 最后确定推荐清单和最少检测的标记数 选用多少标记 品种鉴定/品种鉴别 纯度鉴定：易 杂交稻纯度鉴定：材料及其差异性清楚 品种鉴别：如何解决品种内变异的问题？ 品种内变异性 剩余遗传变异 F6：亲本间差异的3.13% 混杂、串粉、突变 数据库水稻材料 范围： 2002年推广100万亩以上杂交稻组合的亲本和常规稻品种。 来源： 全国各地相关研究、推广、种业机构（16家提供种子）； 中国水稻研究所11个研究组。 水稻品种内遗传变异研究 150个编号 63个品种（A、B当同一品种看待） 1个来源： 20个 2个来源： 23个 3个以上来源： 20个 数据库水稻材料概况 水稻材料品种内变异性分析 同一品种、同一来源不同单株间的差异 同一品种不同来源之间的差异 5个标记 12个品种，每个50个单株 150个编号，每个2单株 5个标记，12个品种各50单株 5个品种无变异7品种具变异： 无 变异品种??标记数，19 变异品种??标记数，16所有标记：一至多个品种内变异单品种变异标记数：1-4个 变异类型 S23: RM1195 无变异 S34: RM17 S85: RM297 变异类型I：主带型/副带型；混杂、自然突变？ S5: RM1195 变异类型II：1:1分离；剩余遗传效应？ 混杂可能是产生变异类型I的主要原因 7个存在品种内变异的品种 4个：2个以上标记检测到变异。 每个品种均发现，同一单株在所有多态标记座位上为副带型。 RM17 RM1195 RM297 RM72 S34 1个来源：20个，无法比较 2个来源：23个，2个品种两单株间具差异，无法比较；余21个可比较 三个以上来源：20个，两单株无差异；可比较 进行比较的总品种数：41个 具差异的品种数：18个 同一品种不同来源之间的差异 品种（名）错误可能是产生不同来源间品种内差异的主要原因 当在3个以上来源的品种中检测到来源间差异时， 表现异常的材料均为同一个来源。 恢复系1 RM17 RM171 RM72 RM171 RM1195 恢复系2 错名恢复系判别示意图 不育系 错名 恢复系 真恢复系 杂交稻 不育系 错名 恢复系 真恢复系 杂交稻 育种家IR64：96个单株 标记数：12个标记（每染色体1个）+ 33个随机分布标记 第2染色体短臂RM154具差异 增加第2染色体短臂6个标记 RM279之上具差异 IR64品种内变异分析 RM154 RM110 RM211 RM233A RM279 RM53 RM174 RM71 2.2 7.6 2.1 1.1 16.8 15.2 2.3 种质库IR64：同样的标记上出现变异 育种家IR64：10种带型；种质库IR64：4种带型 所用育种家IR64的带型均可从种质库IR64带型产生 种质库IR64 vs 育种家IR64 RM211 RM154 种质库IR64 育种家IR64 种质库IR64?目前IR64示意图 水稻材料品种内变异性 较普遍存在 混杂是同一品种、同一来源不同单株间的差异的一个主要原因 品种（名）错误是同一品种不同来源差异的一个主要原因 水稻品种微卫星标记数据库构建 按统一品种序号检测 水稻品种微卫星标记数据库构建 按片段大小重新排序检测 基本数据：各标记多态性频率、品种间变异等 每个标记各品种的带型 每个品种各标记的带型 任两个品种带型比较及其结果 标准标记梯度 数据库构建设想 适合品种鉴别的理想技术 快速简便 品种间变异大 品种内变异小 如何减少品种内变异的影响？ 鉴别标准 科学性 品种间差异性的判断标准 理论推测、同行研究结果；本研究结果 品种内差异性取舍标准 每品种10样品 清楚描述品种内变异 品种间差异只比较主带型 鉴别标准设想 从业人员认同程度 门槛设定？ 纯度、明确的系谱、原始亲本？ 选育阶段的错误？ 特例或有一定比例？如何对待？ 鉴别标准设想 致谢 应杰政 稻米检测中心施勇烽、朱智伟 水稻信息中心王磊、鄂志国 吴建利 Hei Leung 致谢 提供水稻材料：供种单位.xls 水稻研究、推广、种业机构和同行 水稻所多个研究组和同事 资助项目： 科技部科技基础性工作和社会公益研究 农业部标准制定项目 谢谢！ 应用微卫星标记鉴定水稻品种 中国水稻研究所 庄杰云 原理 检测技术选择 品种内变异分析 DNA标记 DNA是生物体遗传物质的载体 基本单元：A、T、G、C DNA标记： 应用