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dads诱导人胃癌mgc803细胞相关基因差异表达研究word格式论文
DADS 诱导人胃癌 MGC803 细胞相关基因差异表达分析硕 士 研 究 生:解娜指导教师:苏琦 教 授摘要目的:研究二烯丙基二硫(Diallyl disulfide, DADS)诱导人胃癌细胞差异表达基 因,绘制其差异基因表达图谱,寻找 DADS 作用人胃癌细胞的侯选相关基因, 为揭示 DADS 抗胃癌机制,开拓人胃癌防治的新途经奠定基础。 方法:体外培养人胃癌MGC803细胞,倒置显微镜和光镜观察DADS处理MGC803 细胞形态的改变;MTT比色法检测不同浓度DADS对MGC803细胞增殖活性的影 响;碱性磷酸酶(Alkaline Phosphatase, ALP)活性检测法观察DADS对MGC803 生化代谢的作用;抑制性消减杂交(Suppression subtractive hybridization,SSH)、 T/A 克隆、测序以及生物信息学方法分析DADS诱导MGC803细胞过程中基因的 差异表达。结果:细胞形态学观察:30mg/L DADS处理MGC803细胞24h后,与对照组相比, 胞浆丰富,细胞核变小,染色变淡,核仁数目明显减少,散在分布生长,部分细 胞变圆,浮起。MTT显示:10、20、30、40、50mg/L DADS对胃癌MGC803细胞增殖的抑 制率分别为15.2%、26.2%、51.4%、57.3%、70.0%,呈浓度依赖关系。ALP活性检测:ALP比活性呈浓度依赖性下降,10、20、30、40、50mg/L 处理MGC803细胞后,其下降率分别为13.7%、25.6%、49.9%、66.5%、72.0%。 总RNA提取和mRNA纯化:提取的总RNA可见明显的28S、18S和5S的清晰无拖尾条带,mRNA为清晰―smear‖带,无DNA和RNA污染。SSH 结果:连接效率检测,Rsa I 酶消化产物 cDNA 与接头连接效率大于 25%;消减有效性实验,未消减样品在 15 次循环时即可见 G3PDH 阳性条带,消 减产物在循环数达 25-30 次才见扩增产物,且产物量明显减少;巢式 PCR 产物 分析显示,消减组产物片段明显少于未消减组产物片段,前者可见清浙的条带,后者呈瀑布状;差异消减 cDNA 文库的建立及鉴定,T/A 克隆后,转化大肠杆菌JM109 菌后,随机挑取 80 个白色克隆,提取质粒 DNA,EcoRⅠ酶切、PCR 分 析发现 60 个克隆具有大小约 100~1000 bp 的插入片段。测序及生物信息学分析:测序共获得 34 个序列完整的克隆。GenBank 同源 性比较,筛选出 DADS 诱导胃癌细胞前后差异表达的 12 个基因,序列同源性为 98%-100 %。正向消减文库中,上调表达基因有细胞周期相关基因 p21WAF1、 ENO1,抗氧化相关基因 FTH1、PRDXⅡ,细胞骨架相关基因 PFN1,细胞代谢 相关基因 MDH2;反向消减文库中,下调表达基因为细胞周期相关基因 PTOV1, 细胞骨架及细胞迁移相关基因 ANXA2、RAC1、WDR1,细胞代谢相关基因 ALDOA 以及癌基因 EWSR1。结论:1. 成功构建DADS诱导MGC803细胞差异表达基因的正、反向消减 cDNA文库。2. 初步筛选了12个DADS诱导MGC803细胞差异表达基因,上调的有p21WAF1、ENO1、 PFN1、 PRDXⅡ、FTH1、MDH,下调的是PTOV1、ANXA2、RAC1、WDR1、ALDOA、EWSR1,分别与细胞周期、细胞骨架、细胞迁移、细胞代 谢、抗氧化等相关。关键词:胃癌;MGC803细胞;二烯丙基二硫;抑制消减杂交;差异表达基因Differentially Expressed Genes Related to Human Gastric Cancer MGC803 Cells Induced by Diallyl DisulfideAbstractObjective: To isolate and cloning differentially expressed genes in human gastric cancer MGC803 cells induced by diallyl disulfide (DADS), explore the related molecular mechanisms.Methods: Cell morphology was observed by inversion microscope and optics microscope MGC803 cells. Inhibition of MGC803 cell proliferation was shown by MTT assay. The activities of alk
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