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中文摘要提取 12 个蓝藻样品（实验室编号为 S1-S12）全 DNA，PCR 扩增 16S rRNA- 23S rRNA 基因间隔序列（ITS）并测序；采用 Cluster X 1.83 对所得序列进行比 对，并对比对结果进行人工校正；采用割胶回收电泳检测、菌液 PCR 及混合模板 PCR 扩增三种方法分析 ITS-L2（最长拷贝）。结果显示：（1）ITS-L2 为假阳性条带, 是由 ITS-S 和 ITS-L1 形成的异源双链。（2）色球藻目中 Synechococcus 7942 ITS 序列仅含一种类型拷贝，包含 tRNAAla 和 tRNAIle 编码序列。（3）颤藻目中 Oscillotoria tenuis、Microcoleus raginatus、 Leptolyngyoideae sp. R8、Leptolyngyoideae sp. R11、Phormidium sp. R30，念珠藻目 中 Anabaena aequolis Borge、Nostoc sp. R34、Nostoc sp. R35、Nostoc calcicola，真 枝藻目中 Hapalosiphon welwitschii、Mastigocladus sp. ITS 序列均为两种类型的拷 贝，其中 ITS-S 均不含 tRNAAla 和 tRNAIle 编码序列， ITS-L1 均包含 tRNAAla 和 tRNAIle 编码序列。以蓝藻中部分念珠藻目和真枝藻目为实验材料，采用 Cluster X 1.83 对 ITS-S 和 ITS-L1 序列进行比对，并对结果进行人工校正；用 Mega5.0 软件对 ITS-S，ITS-L1 进行碱基组成、遗传距离、碱基替换饱和性分析；用基于 ITS-S、ITS-L1 序列的系 统树与基于 16S rRNA 系统树进行比较，以在 16S rRNA 系统树（中出现并得到较 高支持率（BP 值）的分支是否在 ITS-S、ITS-L1 系统树中得到得到重现以及是否 也获得相应的支持率（BP 值）作为参照判断 ITS-S 和 ITS-L1 作为系统学研究的分 子标记的适用性。结果显示：所分析的念珠藻目和真枝藻目 ITS 序列特点如下（1）ITS-S 序列、 ITS-L1 序列平均长度分别为 324.6 bp、583.2 bp。（2）ITS-S 序列的 A、T、C、G 平均含量分别为 36.7%、23.9%、16.3%、23.1%，GC 含量平均值为 39.4%；ITS-L1 序列 A、T、C、G 平均含量分别为 31.8%、25.4%、17.9%、24.9%，GC 含量平均 值为 42.8%。（3）ITS-S 序列中含有 305（433）个变异位点，203（433）个简约信 息位点；ITS-L1 序列中含有 454（727）个变异位点，317（727）个简约信息位点。（4）ITS-S 和 ITS-L1 遗传距离的平均值分别是 0.381 和 0.328。（5）ITS-S 和 ITS-L1I中文摘要 蓝藻 16S rRNA-23S rRNA 基因间隔区序列（ITS）多拷贝分析 碱基替换均未达到饱和。（6）在基于 16S rRNA 序列的 MP 树和 ML 树中获得良好 支持率的分支Ⅰ、分支Ⅱ、分支Ⅲ、分支Ⅳ、分支Ⅴ在基于 ITS-S 序列的 MP 树和 ML 树中仅重现了分支Ⅱ、分支Ⅲ和分支Ⅴ，而在基于 ITS-L1 序列构建的 MP 树 和 ML 树中均得到重现并获得良好的支持率。综合以上结果，可以认为：（1）蓝藻 16S rRNA-23S rRNA 基因间隔序列（ITS） 尚未完成协同进化；（2）ITS-S 很可能是由 ITS-L1 缺失 tRNAAla 和 tRNAIle 编码序 列而来，ITS-L1 更适合作为系统学研究的分子标记。关键词：蓝藻，ITS，多拷贝，协同进化，分子标记作者：粟绒指导教师：史全良Analyses on Multicopy of 16S rRNA-23S rRNA Gene Internal Transcribed Spacer(ITS) of CyanobacteriaAbstractThe total DNA of cyanobacteria (The serial numbers of twelve cyanobacteria specimens are respectively S1-S12 in the laboratory)was extracted. 16S rRNA-23S rRNA gene internal transcribed spacer(ITS) was amplified and sequenced .The sequences were