利用itraq技术分析斑蝥素酸镁对人肝癌细胞hepg2蛋白质表达的影响-using it raq technology to analyze the effect of magnesium cantharidate on the expression of hepg 2 protein in human hepatoma cells.docxVIP
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利用itraq技术分析斑蝥素酸镁对人肝癌细胞hepg2蛋白质表达的影响-using it raq technology to analyze the effect of magnesium cantharidate on the expression of hepg 2 protein in human hepatoma cells
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MS bio-massspectrometry 生物质谱技术
MALD-TOF-MS mastrix assisted laser-desorption
ionization time of flight mass spectrometry
固相蛋白质多肽离子化的 基质辅助激光解吸电离飞 行时间谱
MP metabolic process 代谢过程
MF molecular function 分子功能
PRG peptide reactive group 反应基团
RP report group 报告离子 RPMI-1640 roswell Park Memorial institut-1640 1640 培养基 SOP single-organism process 单一生物过程
SILAC stable isotope labeling with amino acids in cell culture
细胞培养条件下稳定同位 素标记技术
SRB HYPERLINK /link?url=DrEKsD3-NWYR42rBzmck4onl_me-UdE5zEb8PWVirhNA-dwu_F3kQg8FV97aLFFF sulforhodamine B 磺酰罗丹明
TUBA8 tubulin alpha-8 chain α-微管蛋白 8
TCA trichloroacetic acid 三氯乙酸
DE two dimentional gel electrophoresis 双向电泳
2D-LC two-dimensional liquid chromatography
二维液相色谱
利用 iTRAQ 技术研究斑蝥素酸镁对人肝癌细胞 HepG2
蛋白质表达的影响 摘 要
目的:利用定量蛋白质组学技术开展斑蝥素酸镁对人肝癌细胞 HepG2 的抗癌机制研
究;通过比较给药前后细胞蛋白质组的差异表达变化,探寻斑蝥素酸镁可能的作用靶 点和干预的信号通路,为斑蝥素类化合物的后续研究打下基础。
方法:
1、实验分组:将处于对数生长期的细胞,随机分为 2 组:对照组(Control)、斑 蝥素酸镁处理组(Cantharidin acid magnesium,CM);各组继续培养 12 h。
2、利用等重同位素多标签相对定量(Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation,iTRAQ)技术筛选差异表达蛋白(differentially expressed proteins,DEPs)。
3、利用生物信息学分析方法,对上述 DEPs 行基因本体(Gene Ontology,GO) 注释分析和调控通路(Pathway)注释分析。
结果:
1、给药 12 h 后人肝癌细胞 HepG2 增殖明显受到抑制,且细胞形态发生明显改 变。
2、以 Ratio 1.2 或 Ratio 0.83 且 p value 0.05 为筛选标准,共发现 298 个 DEPs, 包括 Tubulin alpha-8 chain(TUBA8)、TNF receptor-associated protein 1(TRAP1)等。 这些 DEPs 中,与肿瘤相关的有 31 个,其中 4 个显著上调,27 个显著下调。
3、GO 功能注释统计发现 1336 个蛋白质与生物过程(Biological Process,BP) 相关,694 个蛋白质与细胞组分(cellular component,CC)相关,392 个蛋白质与分 子功能(molecular function,MF)相关。
4、KEGG Pathway 数据库注释:86 个 DEPs 在 181 条 KEGG 信号/代谢通路中被 注释。其中,被注释 4 个以上 DEPs 的通路有 27 条,其中与肿瘤相关的有 9 条。其 中,最显著的通路为丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinases,MAPKs) 信号转导通路。
结论:
1、斑蝥素酸镁能使肝癌细胞 HepG2 增殖能力显著下降,并能引起多种蛋白质表 达的变化。
2、斑蝥素酸镁可能是通过调控 TUBA8 和 TRAP1 的表达,以及干预 MAPK 信 号转导通路实现抑癌作用。
关键词:斑蝥素酸镁;肝癌细胞 HepG2;差异蛋白质组学;
iTRAQ technology provides insights into influence on the prot eomics of HepG2 cell with treatment by Cantharidin acid magnesium
Abstract
Objective
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