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细胞、细胞器及生物大分子
上述四种生物体细胞色素C的四级结构 蛋白质分析 A.纯化——获得用于研究的足够样品。 层析(根据大小)、电泳(根据电荷)、疏水层析、亲和层析、重组技术(加入纯化标签) B.测序——确定纯化蛋白质的初级结构。蛋白质测序 蛋白质测序利用Edman化学降解法(就是用化学试剂把肽链N端最后一个氨基酸降解下来,然后用层析的手段分离。然后再降解下一个,如此循环) 蛋白测序仪 C.质量测定——确定目标蛋白的分子质量 D.X-射线晶体衍射和核磁共振——确定目标样品的四级结构。 亲和层析——酶与底物作用,抗原抗体结合,配体受体结合等 质谱分析——将分子气化并离子化,再根据其在电磁场内偏离的程度来确定其大小。极其准确但昂贵,可以测定小于100KD的蛋白,有助于检测翻译后修饰 以四种碱基构成的脱氧核苷酸或核苷酸为基本单位通过3,5-磷酸二酯键连接成链状结构构成其一级结构 核酸的理化性质 DNA序列测定常用方法有如下3种: Maxam-Gilbert化学裂解法 化学裂解(直读,Sanger双脱氧末端法也是直读法)法是Maxam和Gilbert等人1977年创建的,用来测定DNA序列。化学法是用化学试剂在A、G、C、T处特定地裂解DNA片段,产生一簇各种长度的短链(等差数列 n=1),经过PAGE和放射自显影后,可以直接读出DNA的顺序。 某些试剂能修饰或破坏DNA链上特定核苷酸的碱基进而使N-糖苷键断裂,暴露出的糖环以β-消除反应,在3’和5’位上断裂磷酸二酯键。使戊糖脱落,用于嘌呤环的试剂是硫酸二甲酯,而联氨可用于肼解嘧啶环。 化学裂解法测序的原理 1、用放射性核素标记待测DNA一侧末端 2、将标记DNA分为G、A+G、C+T、C 4个反应体系 3、用不同的化学试剂处理不同反应体系,随机断裂DNA片段某种碱基中的任何一个,产生一组一端为放射线标记的末端,另一端为不同大小的DNA片段的混合物 4、电泳分离,放射自显影得到互相错落的梯形图谱,即可读出DNA序列 表 特异断裂4种脱氧核苷酸的方法 Nucleic Acid Structure DNA double helix Watson and Crick , 1953. Two separate strands Antiparellel (5’?3’ direction) Complementary (sequence) Base pairing: hydrogen bonding that holds two strands together Essential for replicating DNA and transcribing RNA Sugar-phosphate backbones (negatively charged): outside Planner bases (stack one above the other): inside 三级结构:即超螺旋结构(Supercoiling) 三链、四链结构:三链DNA、端粒 RNA 结构: 许多RNA分子以一单链状态存在, 其通过分子内碱基的配对和相互之间的氢键结合, 形成复杂构像,而这种复杂性反映在细胞中RNA分子呈现不同角色的变化中。 tRNA Ribozyme RNA rRNA 物理性质: a.核酸具有高度的粘性,这主要是因为其有高螺旋率和相对僵硬的缘故; b.其浮力密度为1.7 g/cm-3,可通过密度梯度离心获得DNA; c.核酸具有旋光性和热特性,DNA和RNA的最大吸收波长均为260nm(用于定性定量检测核酸,测定核酸纯度),减色现象:双链DNA与单链DNA或RNA以及单个核苷酸相比,表现为着色不足,因此对紫外线吸收的程度是dsDNAssDNA/RNAnucleotide.在加热的情况下DNA会发生变性成单链,温度降低又可复性(回复双链结构)。 d. 超螺旋:非正常的螺旋状态,其中负超螺旋是进行复制和转录的基础,约占整个DNA的5%。 化学性质: 在pH4-11范围内比较稳定,过酸或过碱都会使其变性。 碱变性提取细菌质粒DNA即是基于此原理。 核酸扩增、杂交 变性,复性——PCR的依据 解链温度 杂交——southern,northern, 而western blot虽与上述杂交相似,但所依据原理不同 核酸测序 Sanger的酶学测序原理 Gilbert的化学测序法 自动测序仪的发明 C0t1/2是指什么? 人神经生长因子 cDNA序列 (3)多糖: 直链淀粉(alpha-Amylose)和纤维素 (cellulose) 是分别通过alpha(1-4) 和 beta(1-4
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