高含油量甘蓝型油菜遗传图谱的构建及油脂含量等性状qtl定位与分析-construction of genetic map of brassica napus with high oil content and qtl mapping and analysis of oil content and other traits.docx
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高含油量甘蓝型油菜遗传图谱的构建及油脂含量等性状qtl定位与分析-construction of genetic map of brassica napus with high oil content and qtl mapping and analysis of oil content and other traits
独创性声明本人声明所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研 究成果。尽我所知,除文中已经标明引用的内容外,本论文不包含任何其他个人或 集体已经发表或撰写过的研究成果。对本文的研究做出贡献的个人和集体,均已在 文中以明确方式标明。本人完全意识到,本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名: 日期:年月日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权 保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅和借阅。 本人授权华中科技大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检 索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。本论文属于保密□,在年解密后适用本授权书。不保密□。(请在以上方框内打“√”)学位论文作者签名:指导教师签名:日期:年月日日期:年月日摘要油菜是世界上最重要的油料作物之一,随着全球对菜籽油需求的快速增长以及 对品质要求的提高,提高含油量及改良菜籽油品质成为当前育种的主要目标之一。 解析含油量及相关性状的遗传基础对培育高含油量和高品质的品种具有重要的意义。 本研究利用含油量差异大于 10%的两个亲本垦 C-8 和 N53-2,构建了包含 348 个株 系的 DH 群体(KN DH),以该群体为材料构建了包含 403 个标记的遗传连锁图, 并将群体进行了九个环境的田间实验,考察了含油量、油酸、亚油酸、亚麻酸、芥 酸和饱和脂肪酸含量等性状,在全基因组水平上对这些性状进行了 QTL(Quantitative Trait Loci)的定位与分析。另外,为了将 KN 群体脂肪酸组分的定位结果与其他群 体进行比较,我们对 TN DH 群体进行了六个环境的实验。主要研究结果如下:(1)高含油量甘蓝型油菜遗传连锁图的构建及与拟南芥基因组的比较作图。利 用 KN 群体的两个亲本垦 C-8 和 N53-2,对 672 对 SRAP 引物、1630 对 SSR 等引物 进行多态性的筛选。用筛选出的 70 对 SRAP 引物及 470 对 SSR 等引物对 KN 群体进 行基因型分析。利用 Joinmap4.0 软件构建了一张包含 403 个标记的遗传连锁图谱, 该图谱长度为 1783.9 cM,包括 275 个 SSR、117 个 SRAP、10 个 STS 和 1 个 IFLP 标记。此外,以 KN 群体 135 个已知序列信息的 SSR 标记和 7 个 STS 标记作为锚定 标记,与拟南芥基因组进行比较作图,共定位了 15 个共线性区段和 56 个插入片段。(2)KN 和 TN 群体含油量及品质性状的 QTL 检测及分析。KN 群体在九个环 境中共定位了六个性状的 254 个 QTL(identified QTL),单个性状定位到了 34 个(芥 酸)至 68 个(含油量)identified QTL。用软件 BioMereator 2.1 将同一性状在不同环 境中定位到的置信区间重叠的 identified QTL 进行整合,共得到 96 个一致性 QTL(consensus QTL),其中含油量、油酸、亚油酸、亚麻酸、芥酸和饱和脂肪酸的 consensus QTL 分别为 24、13、12、20、13 和 14 个。TN 群体在六个环境中共定位 了 10 个性状的 282 个 identified QTL,单个性状定位到了 18 个(花生酸)至 37 个(油 酸)identified QTL。经过整合,共得到 175 个 consensus QTL,其中油酸、亚油酸、I亚麻酸、芥酸、饱和脂肪酸、棕榈酸、硬脂酸、花生酸、二十碳烯酸、二十二碳烷酸的 consensus QTL 分别为 14、21、29、13、15、20、14、16、18 和 15 个。(3)整合图谱的构建及 KN 群体含油量 QTL 与其他群体含油量 QTL 的比较。 利用不同群体遗传图谱上共同的分子标记,以 KN 图谱为参照图谱,利用元分析软 件 BioMereator 2.1 的图谱映射功能,将甘蓝型油菜已发表的定位含油量的 6 个群体(7 张遗传图谱)上的标记映射到 KN 图谱,构建了一张包含 1335 个分子标记的高 密度整合图谱,覆盖整个基因组的 2395.2 cM,标记间的平均距离为 1.8 cM。以该整 合图谱为基础,将 KN DH 群体的含油量 consensus QTL 与已经报道的含油量 QTL 进行比较分析,发现 KN DH 群体定位到的 24 个 QTL 中,有 14 个为新发现的 QTL。(4)Consensus QTL 的整合及 KN 群体与 TN 群体品质性状 QTL 的比较分析。 利用元分析的方法,将两个群体中定位到的控制不同性状的
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