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第7篇 章 基因表达的调控3_RNA对基因表达的调控 药学分子生物学课件.ppt
RNA对基因表达的调节作用;以上我们介绍的基因表达调控是属于DNA与蛋白质之间的相互作用,进来研究发现,细胞内的RNA分子也同样可以对基因的表达进行调控,而且这是一种非常古老、历史悠久的而且有效的调控手段!;非编码RNA (Non-coding RNA, ncRNA);ncRNA在染色体的转录与失活、基因的表达与关闭、细胞周期乃至个体发育等过程中均具有重要的作用。对其进行研究,可能对揭示基因转录后调控、基因敲除、人类疾病防治及生物进化探索有重要意义。;来自基因组的所有转录物(transcript)大致可以分为两大类:编码蛋白质的mRNA和非编码RNA (noncoding RNA)。许多年来基因组中大部分非编码部分被认为是基因垃圾(genetic junk),且通常被认为是没有功能的。;另一方面,一些真核生物基因组的全部序列的确定结果也很令人失望。编码蛋白质的基因数量远远低于人们当初的预想。线虫和昆虫的基因组DNA的数量只是酵母或细菌基因组的两倍,哺乳动物的基因组数量是非脊椎动物的两倍。;在哺乳动物中基因组的数目是非常保守的。人类99%编码蛋白质的基因与鼠的基因是同源的。在不同个体中编码蛋白质的基因占整个基因组比例的可变性大约在0.3%。;人的基因组中只有1%的序列是用来编码蛋白质的;因此,单独的蛋白质序列不是造成物种间和物种内所观察到的差异的原因。所以,生命形式的多样性很可能由DNA基因组中非编码蛋白质和大量的未知部分所编码。;非编码蛋白质的转录物可以分为两大类;持家转录物中组成型表达的RNA种类是细胞正常功能必不可少的,包括参与初级转录物加工的所有种类RNA (snRNA、snoRNA、RNaseP RNA、gRNA),参与翻译(tRNA、rRNA)和翻译质控(tmRNA)的RNA,以及端粒酶相关RNA和SRP RNA等。;调节RNA (regulatory RNA)或核糖核酸调节子(riboregulator),构成了更加多样的组群。从广义上说,它包括真核生物和原核细胞中涉及基因表达不同方面的特异调控的转录物。在调控RNA水平能影响从转录调控到翻译控制的细胞加工过程。;调节RNA的作用机制也是多样化的,最明显的方式是RNA分子通过与mRNA的反义作用影响基因的表达。在调节RNA中,还发现转录因子的调节子和RNA参与染色质结构的修饰,因而在很早期就可以影响基因???表达。;核糖核酸调节子有不同的大小,小的如microRNA,长度大约为20nt;细菌的转录后调节子,长度约100~200nt;在哺乳动物中有超过10kb的长转录物。;迄今为止,大部分的ncRNA都是在实验中获得的。除了经典的持家RNA分子外,对于在基因组序列中如何寻找定位新的ncRNA分子还没有一个明确的标准。关于ncRNA数量问题仍未确定。;现有的证据表明,在所有的生物体当中包括ncRNA在内的分子调控过程是非常普遍的。RNA如此适合这一目的的原因之一是在单细胞水平和分子系统的宏观进化上是高效的。;与蛋白质相比,RNA分子合成和降解所需的能量更少。而且RNA分子较蛋白质更不稳定也是一个优点,因为用作瞬时信号的调节分子应当快速降解。;在许多例子中核糖核酸调节子只需要与靶RNA中的互补序列通过碱基配对的方式行使功能,而蛋白质则需要更为复杂的RNA结合结构域。;调节RNA分子调节基因表达的几种机制;2. 一些ncRNA通过与其他RNA的反义相互作用发挥功能。;反义ncRNA最常见的包括microRNA 和RNA干扰(siRNA)。;通过对人类、果蝇、新杆状线虫和拟南芥的系统研究发现,microRNA代表了一大类在高等真核生物中普遍存在的反式反义RNA,在控制发育相关基因表达方面可能起着关键性的作用。;通过反义相互作用影响基因表达水平的另一种可能机制是RNA干扰(RNAi),即通过形成RNA-RNA双链引发RNA的降解途径。在真核生物中这种RNA干扰机制是十分普遍的。;3. 一些ncRNA可以影响蛋白质的活性。RNA分子可以通过结合蛋白质而影响后者的结构、酶活性及该蛋白质的配体结合活性。已有资料表明有许多ncRNA可以通过与蛋白质相互作用而调控基因表达。;4. ncRNA还参与RNA和蛋白质的亚细胞定位。;5. 除了一些明确知道其作用的非编码转录物之外,还有大量报道的但没有明确功能的ncRNA。一些特异性的RNA只在特异的组织或特定的发育阶段表达,它们的调节功能 目前还没有研究清楚。;这里我们主要介绍2种ncRNA,它们有相同点也有不同点。;1 RNA干扰、基因沉默与siRNA;但是,除了反义RNA能诱发基因沉默,原来预期不能与mRNA发生碱基配对的正义RNA竟然同样能抑制基因表达。;1998年美国的Fire和Mello等在该领域作了深入的研究,他们将与绿色荧光蛋
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