第9章 微生物分类和鉴定.pptVIP

《微生物学》 微生物分类是按微生物的亲缘关系相似程度把微生物归入各分类单元或分类群(taxon)，以得到一个反映微生物进化的自然分类系统、可供鉴定用的检索表以及可给出符合逻辑的名称的命名系统。所以微生物分类的具体任务就是分类（classification）、鉴定（identification）与命名（nomenclature）。 微生物在生物界的地位 生物的界级分类学说，五界系统和三域学说。 1969年Whittaker提出生物分类的五界系统，包括原核生物界、原生生物界、真菌界、植物界和动物界。 三域学说 第一节 微生物的分类单元 与其他生物的分类一样，微生物分类的基本单元也是种（species）。微生物种是显示高度相似性、亲缘关系极其接近、与其他种有明显差异的一群菌株的总称。 一、种以上的分类单元 种以上的分类单元自上而下依次分力 7个等级。 一个或多个种构成一属，一个或多个属构成一科，等等。 第二节 微生物的命名 微生物的名字有俗名（common name）和学名（scientific name）两种。俗名是通俗的名字，如结核分支杆菌俗称结核杆菌，铜绿假单胞菌俗称绿脓杆菌，粗糙豚孢菌的俗名为红色面包霉等等。 第三节 微生物的分类依据和方法 微生物的分类依据主要有：形态特征、生理生化特征、生态特征、抗原特征、遗传特征和化学分类特征等。现以细菌的分类依据为主来说明。 二、遗传特征分类法 遗传特征客观地反映了微生物的亲缘关系，是微生物分类鉴定中一个可靠的特征。尤其在正式定为新属或新种时一定要有其遗传特征的描述。 遗传分类法是指根据核酸分析得到的遗传相关性所做的分类。 四、数值分类法 数值分类是根据数值分析，借助计算机将拟分类的微生物按其性状的相似程度归类的方法。 1．微生物的分类单元有哪些？基本分类单元是什么？ 2．什么是种？种以下的分类单元有哪些？ 3．什么是学名？什么是双名法？ 4．微生物分类的依据主要有哪些？ 5．什么是数值分类法？ * * 基础微生物学 第九章 微生物的分类 在20世纪70年代末美国伊利诺斯大学的C.R.Woese等人对大量微生物和其他生物进行16S rRNA和18S rRNA的寡核苷酸测序，并比较其同源性后，提出了一个与以往各种界级系统不同的新系统，称为三域学说。三域指的是细菌域、古生菌域和真核生物域。 二、种以下的分类单元 鉴定微生物种时，只有在所有鉴别特征都与已知的模式种相同的情况下才能定为同种。 （一）亚种 （二）型 （三）菌株 采用双名法命名时，学名由属名和种名构成，用斜体表示。属名在前，而且第一个字母要大写。种名在后，全部小写。学名后还要附上首个命名者的名字和命名的年份，但这些都用正体宇。如金黄色葡萄球菌（俗称“金葡菌”）Staphylococcus aureus Rosenbach 1884 。 一、常规分类法 常规分类是根据微生物形态、生理生化、生态和抗原等表型特征进行分类的方法，这是微生物分类鉴定中通常采用的方法。 三、化学特征分类法 化学分类法是应用电泳、色谱和质谱等分析技术，根据微生物细胞组分、代谢产物的组成与图谱等化学分类特征进行分类的方法。