生物化学基因表达的调控PPT.ppt

与RNA聚合酶II作用的转录因子 TBP（TFII D） 特异性识别TATA盒 TAF 辅助TBP-DNA结合 TFII A 稳定TFII B与TBP对启动子的结合 TFII B 结合TBP，并结合聚合酶II-TFII F复合物 TFII E 结合TFII H，具有ATP酶和解旋酶活性 TFII F 紧密与聚合酶II结合；也与TFII B结合；阻遏聚合酶II和非特异的DNA序列结合 TFII H 具有解旋酶活性，使DNA解开双链；使聚合酶II的CTD磷酸化；结合核苷酸-切除修复蛋白 2．转录因子与顺式作用元件相互作用的结构基础 转录因子含有三个功能不同的结构域：DNA结合结构域（DNA binding domain）、转录活化结构域（transcriptional activation domain）和与其它蛋白因子结合的结构域（protein binding domain）。 转录因子能够特异性地识别和结合顺式作用元件是DNA结合结构域特定的空间结构所决定的。 DNA结合结构域 转录因子的DNA结合结构域有三种特定的空间结构： 螺旋-转折-螺旋（helix-turn-helix，HTH）结构 锌指（zinc finger）结构 亮氨酸拉链（leucine zipper）结构 螺旋-转角-螺旋（helix-turn-helix） 两个 ?-螺旋（7~9氨基酸残基）通过一段 ?-转角连接，其中一个 ?-螺旋富含碱性氨基酸残基，是与DNA结合的结构域。 HTH是某个大蛋白质分子的一部分，通常以二聚体形式存在。 两个 ?-螺旋之间的距离大约与DNA双螺旋的一个螺距 (3.4nm) 相近，使两个 ?-螺旋的碱性区刚好分别嵌入DNA双螺旋的大沟内。 与DNA结合的螺旋-转角-螺旋模体 lac 阻扼蛋白（PDB ID 1LCC） 与DNA结合的螺旋-转角-螺旋模体 Trp 阻扼蛋白（PDB ID 1TRO ） 与DNA结合的螺旋-转角-螺旋模体 人转录因子MAX（PDB ID 1HLO） 乳糖操纵子的意义 阻遏蛋白的抑制作用和CAP介导的正调控共同担负着原核生物体系内糖源的协调利用。 乳糖操纵子的协调调控方式保证了葡萄糖是原核生物体系优先利用的碳源，并只有在葡萄糖完全耗尽后，原核生物才利用乳糖作为碳源。 乳糖操纵子模型诠释了原核生物基因表达的调节机制，开创了基因表达机制研究的新领域，是生物学的一个划时代的突破。（1965年Nobel奖） 二、翻译水平的调控是对转录调控的补充 原核生物基因表达的时空性决定了转录和翻译过程的偶联。 色氨酸操纵子（trp operon）是典型的转录和翻译过程的偶联。 转录衰减子的精细调节是通过转录和翻译的偶联而实现的。 色氨酸操纵子（trp operon） 结构基因：trpE、trpD、trpC、trpB 和 trpA 上游调控区：调节基因（trpR）、启动子（P）、前导序列（trpL）和操纵序列（O）。 启动子（P）和操纵序列（O）有部分重叠。 开放状态的色氨酸操纵子 当培养基中色氨酸含量很少时，trpR 阻遏蛋白以同源二聚体的形式存在，不能与操纵序列 O 结合，使得RNA聚合酶能够启动转录。 关闭状态的色氨酸操纵子 当色氨酸含量丰富时，色氨酸与色氨酸阻遏蛋白结合，使其能够与操纵序列结合，抑制转录。色氨酸被称为辅阻遏剂（corepressor）。—————粗调开关 色氨酸操纵子 mRNA 前导序列 前导序列的发夹结构 转录中的色氨酸操纵子 当色氨酸的浓度降低时，核蛋白体在合成前导肽的两个色氨酸部位上出现暂停，占据了序列1。而此时的转录仍在进行，序列2和序列3形成了稳定的2:3茎-环结构。RNA聚合酶可以转录5个结构基因。 转录衰减子终止了转录 当色氨酸含量丰富时，有足够的色氨酸用于合成前导肽。核蛋白体可顺利通过序列1，并继续向前与序列2结合。核蛋白体与序列1和序列2的结合，使序列3和序列4形成了3:4茎-环结构。这一结构与随后的多聚U序列使RNA聚合酶终止了转录。 转录衰减子 转录衰减子（transcription attenuator）：操纵子前导区内一段类似于终止子结构的DNA序列，其作用是减弱操纵子的转录，实现对转录过程的精确调节。 转录衰减子的意义 转录衰减子的形成使RNA聚合酶无法对已经启动的操纵子中的结构基因进行转录，而终止转录的茎-环结构的形成又依赖于核糖体在该操纵子中前导序列上进行的翻译。由此可见，衰减作用充分利用了转录和翻译的偶联来实现对氨基酸操纵子转录的精细调节。 氨基酸操纵子前导肽的氨基酸序列 苏 苯丙 组 三、分解代谢和合成代谢操纵子的调节机制 第三节 真核生物基因表达调控 真核生物体系的基因表达要比原核生物体系