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4.从mRNA到蛋白质PPT
2) 核糖体蛋白(ribosomal protein,r-蛋白) 核糖体上有多个活性中心,每个中心都由一组核糖体蛋白构成,单个蛋白要在总体结构内才具有催化活性。 E.coli 核糖体小亚基由21种r-蛋白组成,用S1-S21表示,大亚基有36种,L1-L36。 真核细胞大亚基含有49种,小亚基33种。 3) 核糖体RNA ①5S rRNA 细菌含有120个(G-)或116个(G+)核苷酸。 两个高度保守区域: 一个含有保守序列CGAAC,是与tRNA TψC臂上的GTψCG互作的部位,是5S rRNA与tRNA相互识别的序列; 另一个含有保守序列GCGCCGAAUGGUAGU,与23S rRNA中的序列互补,是5S rRNA与大亚基互作的位点。 3) 核糖体RNA ②16S rRNA 与mRNA、大亚基和tRNA的反密码子直接作用。 存在于小亚基内,1475-1544个核苷酸构成,含有少量修饰碱基。 结构保守,3’端保守序列ACCUCCUUA,与mRNA 5’端翻译起始区富含嘌呤的序列(SD序列)互补;靠近3’端还有一段与23S rRNA互补的序列,在大小亚基的结合中起作用。 ③ 23S rRNA 含有2904个核苷酸,存在于大亚基中,有肽基转移酶的活性。 E.coli 第1984-2001存在一段能与tRNAMet互补的片段→23S rRNA可能与tRNAMet的结合有关。 靠近5’端有一段12个核苷酸的序列与5S rRNA序列互补→大亚基上 这两种RNA间可能 存在互作。 ④ 5.8S rRNA 真核生物核糖体大亚基特有的rRNA,160个核苷酸,含有修饰碱基。 含有5S rRNA中与tRNA相互识别的保守序列CGAAC →可能与原核生物5S rRNA具有相似的功能。 ⑤ 18S rRNA:存在于真核生物核糖体的小亚基中,酵母的18S rRNA由1789个核苷酸组成,3’端与E.coli 16S rRNA有同源性。 ⑥ 28S rRNA,长度3890-4500bp,功能未知。 rRNA之间以及与tRNA、mRNA之间的相互关系是建立在序列互补或同源的基础上的。 原核细胞核糖体 真核细胞核糖体 4) 核糖体有3个tRNA结合位点 A位点:新进入的氨酰-tRNA的结合位点; P位点:肽酰-tRNA的结合位点; E位点:延伸过程中的多肽链转移到氨酰-tRNA上释放tRNA的位点。 tRNA移动顺序是A位→P位→E位,通过密码子与反密码子间的互作保证反应正向进行。 4) 核糖体有3个tRNA结合位点 tRNA的氨基末端定位在大亚基上,另一端的反密码子与结合小亚基的mRNA相互识别, tRNA结合位点横跨核糖体,位于大小亚基的交界面。 4.3.2 核糖体的功能 核糖体包括多个活性中心:mRNA结合部位、A位、P位、肽基转移部位及形成肽键的部位,还有负责肽链延伸的各种延伸因子的结合位点。 小亚基负责对mRNA进行序列特异性识别,如起始部分的识别、密码子与反密码子的互作等, mRNA的结合位点也在小亚基上。 大亚基负责携带氨基酸及tRNA,包括肽键的形成,与AA-tRNA、肽酰-tRNA的结合等。 4.4 蛋白质合成的生物学机制 4.4.1 氨基酸的活化 4.4.2 翻译的起始 4.4.3 肽链的延伸 4.4.4 肽链的终止 4.4.5 蛋白质前体的加工 4.4.6 蛋白质的折叠 4.4.7 蛋白质合成的抑制剂 4.4.1 氨基酸的活化 氨基酸要在氨酰-tRNA合成酶的作用下与tRNA结合,生成活化氨基酸—AA-tRNA,才能被运到核糖体中,参与肽链的起始和延伸。 至少存在20种以上具有氨基酸专一性的氨酰-tRNA合成酶,能够识别并通过氨基酸的羧基与tRNA 3’端腺苷酸核糖基上的3’-OH缩水形成二酯键。 4.4.2 翻译的起始 细菌中,起始氨基酸是fMet,与核糖体小亚基结合的是N-fMet-tRNAfMet;真核生物中,起始氨基酸是Met,Met-tRNAiMet与小亚基结合起始肽链合成,普通tRNAMet只能进行肽链延伸。 在模板mRNA编码区5’形成核糖体-mRNA-起始tRNA复合物,将起始氨基酸放入P位点。 3个步骤: ①小亚基先与IF-1、IF-3结合,通过SD序列与模板mRNA结合; ②在IF-2和GTP帮助下,fMet-tRNAfMet进入小亚基的P位,反密码子与起始密码子配对; ③带有tRNA、mRNA和翻译起始因子的小亚基复合物与大亚基结合,GTP水解,释放翻译起始因子。 1) 原核生物翻译的起始 7种成分:①小亚基;②mRNA ;③fMet-tRNAfMet;④翻译起始因子IF-1、IF-2和IF-3;⑤GTP;⑥大亚基
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