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在人类基因组DNA中存在高度变异的短的超变区，即数目变异的串联重复序列区（ variable number of tandem repeats，VNTR），如（CA）n 。这些短的重复顺序长度不一样，但它们都几乎都共有一种“核心顺序”。“核心顺序”长10～15bp。如果人工合成很短的重复顺序作为DNA分子杂交的探针，同经限制性内切酶酶切的人体DNA作Southern杂交，可以获得长度不等的杂交带。杂交带的数目和分子量大小几乎不可能有两个人会完全相同的，因此把这种杂交带的图型称为“DNA指纹”（DNA finger-printing），意思是DNA的杂交带型同指纹一样，也是每个人所特有的。 在“DNA指纹”与VNTR中的应用 DNA Fingerprinting Six Different Phenotypes/Genotypes with only 3 VNTR Alleles DNAs from different individuals can be distguished by analysis of VNTR alleles. For a simple case of only 3 alleles, 3 heterozygous and 3 homozygous patterns are possible (see diagram). For n different alleles, there are (n)(n+1)/2 possible genotypes. 基因亲子鉴定也叫“DNA指纹图谱分析” ，其道理和血型鉴别是一样的，只不过筛选范围更大、结果更精确而已。但由于常用的ABO血型只有四种类型，即A、B、O和AB型，平均4人以上就会出现重复； 与血型不同的是，基因是成对存在的，每个人的一种基因都有两条基本亚型（等位基因）。每个被挑选做基因亲子鉴定的“标记基因”总共有8-15种亚型，而这些亚型两两配对，使每个人身上的两亚型有所不同，可组合了几十乃至上百种不同的基因“血”型。这样一来，人群中具有两条完全相同的类型的人就很少； DNA指纹图谱呈孟德尔方式稳定遗传，所以，孩子的两种亚型必定一种来自父亲，另一种来自母亲，这是遗传决定且终生不变的。只要在父母和孩子身上各取1-5毫升血做基因检查，一旦在父亲的两条基因和母亲的两条基因中各找到一条与孩子相同的基因，就证明了他们之间存在亲子关系。 “DNA指纹”与亲子鉴定 多数情况下用一个标记基因能够将两个孩子区分开，但它也存在基因完全相同的可能。但如果同时分析两个标记基因，假设每个标记基因相同的占到２０％，则两个都相同的可能性只有1/5×1/5=1/25。若同时分析9个标记基因，则因基因完全相同而出现重复的机会会降低到近二百万分之一； 目前国际上亲子鉴定最多用到14个标记基因，可使重复率降低到60亿分之一，这对于50亿的全球人口来说，几乎不可能重复； 迄今为止发现，我们每人体内都含有7000余个标记基因，用它们可做出若干套“基因（DNA）指纹图谱”，其精确程度远远超过我们皮肤的指纹; 皮肤的指纹可以磨掉，外表可以因整容而改变，一个人的基因是不可能全部更换的。因此，DNA指纹图谱可谓现今最精确的身份证明。 How is DNA Fingerprinting Done? 1. Performing a Southern Blot  2. Making a Radioactive Probe  3. Creating a Hybridization Reaction  4. VNTRs  Southern Blot Isolating the DNA； Cutting the DNA； Sorting the DNA pieces by size； Transfering membrane; Denaturing the DNA and probe ； Blotting the DNA (hybridization reaction)； X-ray development. Making a Radioactive Probe 1 2 3 4 5 Creating a Hybridization Reaction Number Tandem Repeats (VNTRs) VNTRs Relationship? “DNA指纹”与法医鉴定 1985年Teffreys等将“DNA指纹”应用于法医鉴定。他们从血斑、精斑或新鲜毛发根部抽提微量DNA后作印迹杂交。从4年前的精斑、血斑样品中仍能提取出来未降解的DNA，从中提取DNA后可准确无误地做出鉴定，为法医鉴定提供一种新的有效方法。 分子杂交是依据相应碱基配对而使两条链中互补的核苷酸