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Race方法克隆云芝疫调节蛋白基因
Race方法克隆云芝免疫调节蛋白基因 摘 要:云芝是非常具有应用前景的药用真菌,但是目前关于真菌免疫调节蛋白基因克隆的方法还较少,因此本研究以云芝菌丝体为研究材料,通过Race方法从云芝中克隆出云芝免疫调节蛋白基因,并获得了云芝基因的全序列,通过本研究,以期为药用真菌的克隆方法提供有价值的参考。 中国论文网 /1/viewhtm 关键词:race;免疫调节蛋白基因;克隆 中图分类号: Q939.5 文献标识码:A DOI:10.11974/nyyjs.20160931005 云芝是最具药用价值的真菌之一。其又被称为白芝或彩绒革盖菌,在分类学上属于真菌门、担子菌纲、多孔菌目、多孔菌科、云芝属。最新的研究表明,云芝中主要活性成分除了云芝多糖,云芝免疫调节蛋白也发挥了重要的作用。真菌免疫调节蛋白是小分子蛋白质,来源于高等担子菌的子实体,能够抗过敏反应、加强核酸和蛋白质的合成、提高淋转效率、提高机体的免疫功能。随着对真菌生物功能蛋白研究的日益深入,真菌免疫调节蛋白已成为学者研究的重点内容。 基于以上,本研究采取race方法,从云芝中克隆出云芝免疫调节蛋白,为真菌免疫调节蛋白基因克隆的研究提供新的方法。为进一步开发真菌资源提供基础的研究数据。 1 实验材料和试剂 1.1 实验材料 云芝(Coriolus versicolor),购自于吉林农业大学菌物研究所。 1.2 菌种 细菌菌株 E.coli DH5α为本实验室保存。 1.3 实验试剂 DNA Marker等购自于大连宝生生物有限公司;其他生化试剂均为国产分析纯。 1.4 培养基 YPG培养基:胰蛋白胨 10g/L,酵母提取物 5g/L,葡萄糖 20g/L(或麦芽糖15g/L),MgSO40.5g/L,KH2PO41g/L。配制固体培养基时加琼脂粉15g/L。110℃高压灭菌30min。 2 实验方法 2.1 云芝菌丝体的培养 在无菌条件下,将云芝菌种用接种针挑取一小块菌丝体接种于液体YPG培养基中,在25℃培养箱中震荡培养5~7d。 2.2 云芝免疫调节蛋白基因的克隆和表达载体的构建 2.2.1 云芝基因组总RNA提取 无菌水洗菌丝体,用液氮预冷研钵,在液氮中研磨菌丝体至细粉状,转入1.5mL离心管中,加入500μL提取液; 继续加入1mlRNAisoReagent; 将上述研磨好的粉末加入以上离心管中,轻轻混匀,离心(12000rpm,5min); 吸取上清,放入一个新的离心管中,向其中加入200μL氯仿,混匀,离心(12000rpm, 15min); 吸取上清,加入等体积异丙醇,充分混匀,在15~30℃静置20min,离心(12000rpm,10min); 弃上清,加入1mL75%的乙醇,上下颠倒,12000rpm,离心(12000rpm, 5min)弃乙醇; 干燥沉淀2~5min(室温),加入50μL的RNase-free水使 RNA完全溶解,置于-80℃保存备用。 2.2.2 云芝免疫调节蛋白(Fip-cve)基因的克隆 2.2.2.1 中间片断的获得: 以赤灵芝(G.lucidum)Fip-glu基因序列(GenBank No:M58032)为基础,设计同源引物P1和P2,来完成云芝同源区域中间片断的克隆。引物序列为: P1:5’TGACCGACAAGGCGTACACGTAC’3 P2: 5’acctggatcgtgttcgtgtccg’3 反转录反应体系:10μL体系,1.0μL dNTP,0.5μL Primer oligodT,0.25μL RNase inhibitor,1μL10×RT Buffer,2.75μLRNase Free H2O,2μL MgCl2,2μL RNAsample 0.5μL AMV。 程序为:30℃10 min,42℃30min,99℃5min。 PCR反应体系:50μL体系,包括0.25μLTaq酶,5μL PCR buffer,1μL dNTP(2.5 nmol/L),1μL引物A(20 nmol/μL),1μL引物B(20 nmol/μL),模板DNA 1.5μL,ddH2O 40.25μL。 反应程序为:(94℃预变性5min,94℃10s,55℃ 20s,72℃30s,共31个循环, 然后72℃5min)。凝胶回收扩增产物,将产物连接于pMD18-T载体,转化大肠杆菌,提取质粒后测序用于下一步。 2.2.2.2 3’ RACE程序 根据上述片断的测序结果,设计上游引物P3,用于3’ RACE,引物序列为:P3 :5、ACCTCGGTGTG-CGCCCCTCATA
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