时空变化环境下细菌趋化行为的分析-analysis of bacterial chemotactic behavior in space-time changing environment.docx

时空变化环境下细菌趋化行为的研究司光伟凝聚态物理导师：欧阳颀教授，涂豫海教授摘要感知环境变化、对感知的信息加工处理并做出相应的响应是生命的基本特征。生物的化学趋向性是其中典型的代表，许多生物具有响应化学物浓度变化、趋利弊害行为。其中，大肠杆菌的趋化性是生物学中研究得最为清楚的信号传导系统之一。由于其结构简单却拥有丰富的生物学行为特性，如稳健的适应、对信号的放大、超敏感响应等，大肠杆菌趋化性已成为理想的模式系统，是生物物理等交叉学科的重要研究素材。到目前为止，细菌趋化性研究领域里大多数出色的成果都是通过对固定住的细胞施加时序变化的化学浓度信号研究得到的，这些测量结果使我们对细菌趋化性信号通路的动力学性质有了深刻的理解。然而，自然状态下细菌是主动游动的，并且环境中的化学物质浓度既会有空间上的梯度，也会随时间变化。细菌在这样复杂的环境下的趋化行为并不能由先前方法研究的结果直接来理解。本论文从实验和理论两个角度来研究在时空变化环境下细菌的趋化行为。论文主体可以分为三个部分：1.应用微流控技术设计出能够定量控制细菌微环境的实验装置。在实验中定量研究生物趋化性的最大挑战在于如何精确控制时空变化的化学物浓度环境。通过创新设计和微加工方法，我们首次在微流芯片中实现了对细菌微环境的精确时空控制。空间控制精度可达微米量级，时间控制精度可达秒量级，并在百微米的空间尺度上实现了周期从几十秒到几十分钟的振荡