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细菌分类鉴定第三部分课件
6.气相色谱技术用于微生物鉴定 气相色谱技术可分析微生物细胞组分和代谢产物中的脂肪酸和醇类等成分,对厌氧菌的鉴定十分有用。 (三)数值分类法(统计分类法) 是一种依据数值分析的原理、借助现代计算机技术对拟分类的微生物对象按大量表型性状的相似程度进行统计、归类的方法。 现代的数值分类学必须借助于电子计算机,因此又称电子计算机分类学。 在工作开始时,必须先准备好一批待研究菌株和有关典型菌种的菌株,它们被称作OTU(操作分类单位,operational taxonomic units)。要用50个以上甚至几百个特征进行比较,且所用特征越多,其结果也就越精确。在比较不同菌株时,都要采用相同的可比特征,包括形态的、生理的、生化的、遗传的、生态的和免疫的特征等。 数值分类的基本步骤为: 1、计算两菌株间的相关系数 2、列出相似度矩阵 3、将矩阵图转换成树状谱 微生物的微型、简便、快速或自动化鉴定技术 1、API细菌数值鉴定系统 2、“Enterotube”系统 3、“Biolog”全自动和手动细菌鉴定系统 1、API细菌数值鉴定系统 该系统通过数学的编码技术将细菌的生化反应模式转换成数学模式,给每种细菌的反应模式赋予一组数码,建立数据库或编成检索本。通过对未知菌进行有关生化试验并将生化反应结果转换成数字(编码),查阅检索本或数据库,得到细菌名称 能同时测定20项以上生化指标 组别 试验项目 代码 结果 结果代码 总值 1 硫化氢 苯丙氨酸 葡萄酸盐 4 2 1 - - + 0 0 1 1 2 靛基质 甲基红 枸橼酸盐 4 2 1 - + + 0 2 1 3 3 尿素 动力 产气 4 2 1 + + + 4 2 1 7 4 赖氨酸 鸟氨酸 棉子糖 4 2 1 + + - 4 2 0 6 5 山梨醇 侧金花醇 木胶糖 4 2 1 + + - 4 2 0 6 2、“Enterotube”系统 3、“Biolog”全自动和手动细菌鉴定系统 使用96孔板。 Section 7 微生物资源的利用 ? 一、什么是微生物资源? 1992 年联合国环境发展大会通过了《生物多样性公约》(Convention?on?Biological?Diversity),公约指出:“生物资源是指对人类具有实际或潜在用途或价值的遗传资源、生物体或其部分、生物群体或生态系统中任何其他生物组成部分。”“最好在遗传资源原产国建立和维持产地保护及研究植物、动物和微生物的设施”。 所以,我们研究微生物多样性与研究动、植物多样性同样重要,无论是维持生态系统的平衡,还是提供对人类具有实际或潜在用途或价值的资源,动物、植物、微生物都有其不可替换的作用,即独特之处,作为资源,它们都有自身的特点。 二、微生物资源的特点 1.具有潜在用途或价值的遗传资源特 别丰富,代谢种类繁多。 2. 微生物多样性未知处太多 3 .微生物繁殖快、易变异、个体小, 是工业化大规模自动化生产和提高效 率的理想资源。 三、资源的开发利用急待拓宽和深入 开发利用微生物资源大概可以归纳为四个方面的利用:首先是对微生物菌体的利用。例如:活性酵母、单细胞蛋白、微生物杀虫剂、细菌肥料、食用菌等。第二,微生物代谢产物的利用。例如:抗生素、氨基酸、有机酸、维生素、醇类、核酸、多糖、酶制剂等。第三,微生物特性的利用。例如:甾体转化、湿法冶金、石油勘探、环境治理等。第四,微生物基因的利用。例如:将苏云金杆菌毒蛋白基因转入作物,培育出抗虫作物;将产碱杆菌聚b- 羟基丁酯(Poly- ?b ?-ydroxybutyrate,PHB)基因转入拟南芥,可以在转基因拟南芥中大量产PHB,其产量达到了叶子鲜重的1%,有望利用微生物基因在植物中生产出可降解的生物塑料原料,治理“白色污染”。 (一) 微生物在药物生产中的应用 1、抗生素 2、微生物多糖 微生物多糖可由许多细菌和真菌产生。根据多糖在微生物细胞中的位置,可分为胞内多糖、胞壁多糖和胞外多糖 。其中 胞外多糖由于产生量大 ,且 易与菌体分离 ,而得到广泛关注。微生物多糖有着
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