皖南黑猪学业胆固醇含量相关候选基因研究-study on candidate genes related to cholesterol content in southern anhui black pigs.docxVIP

Anhui Agricultural University Master Degree Dissertation Study on Candidate Genes of Blood Cholesterol Levels in Wannan Black pig Postgraduate: He Xiao-lei Supervisor: Prof. Yin Zong-jun Co-supervisor: Ph.D Ding Yueyun Specialty: Animal Genetics, Breeding and Reproduction Research Field: Animal Molecular Genetics and Breeding College of Animal Science and Technology, Anhui Agricultural University, Hefei, 230036 Hefei, Anhui, China June, 2013 本论文受以下项目资助 国家 863 高技术研究发展计划（2011AA100302） 国家自然科学基金项目 科技部星火计划重点项目 (2010GA710001) This paper is supported by： The National High Technology Research and Development Program of China (863 Program 2011AA100302) National Natural Science Foundation Project (No. Key Program of Science and Technology Spark Plan (No. 2010GA710001) I I 摘要 本研究以皖南黑猪为试验材料，选择在动物体内胆固醇代谢过程中发挥重要作用 的功能基因胆固醇调节元件结合蛋白裂解激活蛋白(SCAP)基因、胆固醇酯转运蛋白 (CETP)基因及三磷酸腺苷结合盒转运体(ABCA1)基因为候选基因，采用 PCR-SSCP 技 术检测 SCAP、CETP 基因部分区段的遗传变异，筛查单核苷酸多态性位点分析其多态 性，并运用 SPSS 程序中的 GLM 模型分析所检测到的遗传变异与血液胆固醇含量指 标的关联性。并采用 RT-PCR 技术检测 ABCA1 基因在肝脏、心脏等不同组织中的表达 差异。研究胆固醇含量相关功能基因的结构、表达、遗传变异及其与相关性状的关联 性分析，筛选其关键性的多态性位点可能会提供一些新的分子标记，对猪在胆固醇方 向相关研究工作的开展具有重要的理论和实践指导意义。 经研究发现： （1）皖南黑猪 SCAP 基因第 2 外显子 813 碱基处发生 G→T 突变（G813T），G813T 位点在试验群体中只检测到突变的 TT 基因型，该突变引起氨基酸由蛋氨酸变成异亮 氨酸。该位点 TT 基因型频率为 1.0，等位基因 T 基因频率为 1.0。 （2）皖南黑猪 CETP 基因第 1 内含子 795 碱基处发生 C→T 突变（C795T），C795T 位点在试验群体中检测到 CC、CT、TT 三种基因型，其基因型频率分别为 0.6250、0.3036 和 0.0714，等位基因 C 和 T 的基因频率分别为 0.7768 和 0.2232，表现为中度多态（PIC ＝0.2866）。该位点的 χ2 值为 1.7388（P＞0.05），处于 Hardy-Weinberg 平衡状态。 （3）皖南黑猪 CETP 基因 C795T 位点的不同基因型个体间血液 HDL-C 和 TC 含 量有显著差异（P＜0.05），而血液 LDL-C 和 TG 含量差异不显著。 （4）皖南黑猪 ABCA1 基因在不同组织中有不同程度的表达，肝脏中的表达量最 高，其次是肺脏，肾脏中的表达量最低；肝脏和肺脏的表达量与其他组织中的表达量 存在极显著差异（P＜0.01），心脏的表达量与脾脏和肾脏的表达量存在显著差异（P ＜0.05）。 （5）皖南黑猪肝脏 ABCA1 mRNA 表达量与 TC 含量呈显著负相关，相关系数为 -0.913；与 LDL-C 含量呈中等偏低的负相关，相关系数为-0.475。 关键词：皖南黑猪，SCAP 基因，CETP 基因，ABCA1 基因，胆固醇含量 II II Abstract In this study, Wannan Black pigs were used to detecting po lymorphism of SCAP gene and CETP gene-candidate genes associated with