中药信息学研究方法与应用荟萃.docVIP

中药信息学的研究方法与应用荟萃 　　摘要：中药信息学是中药科学与信息科学相结合的一门以中药数据为研究对象的学科，是中药研究信息化进程的必然产物。中药信息学的蓬勃发展促进了中药的现代化和国际化的发展。通过查阅2000～2014年发布的有关中药信息学的文献，总结了中药信息学的研究方法与应用，并提及了国内外近几年有突破性的中药信息学科研成果，如《三维药效团数据库》的建立与应用、随机森林等数据挖掘技术在中药信息学中的应用，并指出为了加快中药信息学的发展，较大程度的推进中药现代化仍需解决的若干问题。 　　关键词：中药信息学；中药现代化；中药数据库 　　1中药信息学的产生背景 　　20世纪70年代前科学家主要对狭义信息论进行研究，信息论当时也主要被应用在通信领域；20 世纪70年代之后一些科学家通过不断引入现代科学技术的最新成果，才开始研究广义的信息论，物理、化学、生物学、计算机科学、心理学、管理学以及经济学等学科同时被广泛的与有关的信息理论发生嵌合。中药信息学在信息学向中药学领域的逐渐渗透中产生。现在，我们通过对中药的研究，包括对中药的原科植物、化学成分、药理药效作用及从古至今对中药的传统经验的理论研究，从中得出的许多有关中药的适用范围、功效等相关信息，中药信息学通过分析整理这些信息，从而促进了中药信息学的快速发展。 　　中药信息学（TCM Informatics）由北京中医药大学乔延江教授最早提出， 2006年，乔延江教授及其研究室人员更加详细的为中药信息学的定义做了新的论述：应用数学、化学、计算机图形学、生物学等技术方法，研究中药各类信息的获取、处理、存储、共享、分析和解释；同时阐述了中药信息学研究所涉及的一些相关内容[1]。 　　2中药信息学的研究方法 　　中药信息学研究的相关内容包括从中药复方到中药化学物质基础，蕴藏着对大量中药学、化学、药理学和生物医学信息的文献资料进行分析、归类和整编[2]。中药信息学①是从中医药学科的角度阐明并论述了解释各部分相关信息的产生、获取和分析等，②通过使用中药信息学的相关论点及有效的手段来看待和研究中药学领域中的信息获取和处理问题，总结出一些有关中药采集、炮制、置换、获取、传递、分发、储存、解释及利用等过程中的一般规律。由于中药系统表现的临床疗效远远超出其各组分疗效的线性加和的复杂性[3]，中医用药理论与中药信息学研究的科学方法及其研究所依赖的整体准则和功能准则有很高的契合度，数据库方法（如人工智能与专家系统、数据库知识发现）、化学计量学方法（包括因子分析、人工神经网络、遗传算法、模拟退火、免疫算法等）、计算机辅助药物设计方法等都被中药信息学应用到对中药的研究中，具体研究方法如下。 　　2.1信息的采集与加工存储 这是信息化研究的基础，收集信息并合理组织，建立数据库。 　　2.2信息的提取 即数据库知识发现。目前我国中医药信息资源建设已初有成效，建成了全文数据库、主题数据库、信息集成平台等许多不同种类的中医药数据库。所取得的成果有由乔延江教授带领的研究室运用计算机模拟技术开展的计算中药药效分子的各种参数、确定中药药效团的搜寻研究，同时建立了《中药化学成分数据库》和《三维药效团数据库》。 　　2.3信息的处理 筛选、预测、评价从信息中总结的规律与模型，在中药的科学研究与生产过程中实现中药的现代化，必须建立通用规则，搭建科学平台。 　　3中药信息学的应用意义 　　中药信息学是中药与载体（环境和人体）之间进行的信息交换和相互作用，是应用现代信息技术来研究中药本身所具有的各种特征信息。中药信息学可广泛用于在中医药研究应用及中医药基础临床研究数据的采集、处理、分析加工和管理等，极大推动中医药学发展。 　　3.1中药设计研究 中药信息学的研究不仅可以提供中药活性成分结构、中药性味、归经和功能以及配伍规律等信息，还能提供药物所属的归经，药物治疗疾病的病因病机，治疗疾病的有效机制及相关临床疗效等，通过中药信息处理系统对相关数据进行自动分析处理，可以用计算机模拟进行自动化组方、工艺设计、质量控制、疗效判断等，从而加快中药新药的研究开发。 　　3.2中药现代化 中医药学对现代技术的吸收融合需要中药信息学的研究来催化，推动了中医药现代化。中医走向世界就需要对东西方传统的现代哲学和科学，特别是信息科学语言学等有所了解，同时必须对中医学的信息学属性有较深刻的了解。因此，中药学与现代信息学相结合是中药国际化必由之路。 　　3.3数据库知识发现 数据库知识发现（KnowledgeDISeoveryinDatabases，KDD）是从大量数据中获取信息的有力工具[4]。其中中药数据库知识发现是是中药信息学研究的重要内容，中药进行信息化研究的重要过程。随着中药现代研究的加深及计算机技术迅速发展，中药