4.1生物信息数据库简介幻灯片.pptVIP

第四章 生物信息数据库 4.1 生物信息数据库简介 4.1.1 生物信息数据库基本概况 4.1.2 生物信息数据库分类 4.1.3 数据库专业组织 4.1.4 全球生物数据库概览 4.1.1 生物信息数据库基本概况 1960年代 第一个分子生物学数据库 由Fred Sanger的胰岛素序列测定（1955） 蛋白质数据库PSD（Protein Sequence Database） 由Margaret Dayhoff 创立，即PIR的前身；1978，scoring matrices——PAM 生物信息数据库应满足5个方面的主要需求 1 时间性 新发表的数据，应该能够在很短的时间内（几个小时至几天）通过国际互连网访问。 2 注释 每一个基本数据（如序列），应附加一致的、深层次的辅助说明信息 3 支撑数据 提供访问原始数据 4 数据质量 数据库管理机构对数据来源进行检查 5 集成性 例如，从某个核酸序列出发，通过交叉索引，可进一步得到对应的基因、蛋白质序列、蛋白质结构，得到蛋白质功能的信息。 生物信息数据库几个明显的特征 1 数据库的更新速度不断加,数据量呈指数增长趋势 2 数据库使用频率增长更快 3 数据库的复杂程度不断增加 4 数据库网络化 5 面向