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布加氏综合征致病基因的外显子测序研究-临床医学专业论文
万方数据
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学位论文作者(签名): 日期: 年 月 日
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学位论文作者(签名): 日期: 年 月 日
摘
摘 要
摘 要
研究生:李文犀 导师:薛焕洲 教授 郑州大学人民医院 肝胆外科 河南 郑州 450003
背景及目的
原发性布加氏综合征(primary budd-chiari syndrome,BCS)发病机制及病因 复杂,且亚洲国家与欧美国家存在明显的地域差异。在美欧等西方国家,原发 性 BCS 病因多与静脉血栓形成相关,目前研究已经发现 JAK2 V617F、FⅤL、F ⅡG20210A、MTHFR 等多种基因突变与原发性 BCS 相关,这些基因均是血栓 形成的危险因素,它们与多种外部因素共同造成了患者血液处于高凝状态,肝 静脉血栓形成导致肝静脉阻塞而最终演变为原发性 BCS;然而在包括日本、中 国以及印度等亚洲地区,在西方国家内高表达的相关基因却鲜有表达,东方国 家原发型 BCS 相关基因仍然处于未知状态。
分子生物学技术飞速发展,下一代测序技术以其高通量、低成本的独特优 势,使人类全基因组测序成为可能,也为原发性 BCS 相关基因的研究带来了新 的希望。传统的 Sanger 测序广泛运用于基因结构的研究,然而其数据产出通量 低、成本高、操作复杂的缺陷使其在更深层次的基因研究受限。相较于 Sanger 测序,NGS 测序通量是其数千倍乃至数万倍,而其成本仅仅是前者的千分之一, 许多学者已经依靠 NGS 平台发现此前从未发现的基因突变,显示其在今后基因 研究领域潜力无限。
通过全基因组外显子组测序技术,对原发性 BCS 患者的全部外显子进行筛 查,以期发现特异的基因突变,对原发性 BCS 的病因、发病机制等进行进一步 的探讨。
原发性 BCS 是一罕见的临床综合征,但在我国河南、安徽等地区发病率明 显高于其他地区,具有明显的地域以及家族聚集现象。发现原发性 BCS 可能存 在的致病基因,可以针对高危人群进行早期的检测及预防。
I
方法
1. 病例采集
本科室长期随访一原发性 BCS 家系。家系内共 8 人(5 名男性,3 名女性), 所有人均接受下腔静脉彩超及 CT 下腔静脉成像检查,确诊原发性 BCS 患者 3 名。采集外周静脉血标本。
2. 外显子组测序
根据外显子组测序的规范流程,提取基因组 DNA,建立文库,外显子测序, 上机测序,生物学信息分析,确定候选基因。
3.数据分析 通过文献复习,蛋白质功能预测,突变频率等总结出感兴趣的候选基因。 4. 候选基因验证
对候选基因进行 PCR/sanger 测序验证。
结果
外显子组测序结果生物信息学分析结果得出 2 例患者共有 53 共有基因突
变,从中筛选出 2 两个基因突变:HSPG2 c.C4508T、GPR126 c.T3242G。对这 两个突变进行验证均得到了阳性的验证结果。
结论
HSPG2 c.C4508T 和 GPR126 c.T3242G 两个新发现的基因突变位点可能与下 腔静脉隔膜型布加氏综合征具有密切的关系。
关键词: 布加氏综合征;全基因组外显子组测序;HSPG2;GPR126
II
Abstract
Abstract
Abstract
Postgraduate:Wenxi Li Supervisor:Huanzhou Xue
People’s Hospital of Zhengzhou University Zhengzhou Henan 450003
Background and purpose
Pathogenesis and etiology of primary Budd-Chiari syndrome (BCS) are complex and there are obvious regional differences between eastern and w
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