小麦YABBY基因生物信息学分析.docVIP

小麦YABBY基因生物信息学分析 　　摘要[目的]对小麦YABBY基因家族成员TaYAB1与TaCRC基因进行生物信息学分析。[方法]利用相应的计算机软件及数据库，对这2个基因的理化性质、结构与功能进行分析预测，同时构建其同源基因的系统进化树。[结果]TaYAB1与TaCRC蛋白为不稳定亲水性蛋白，其蛋白结构中无跨膜区，属于非分泌性蛋白。TaYAB1与TaCRC蛋白亚细胞定位于细胞核，有多种二级结构形式。功能分析预测这2个蛋白具有转录与转录调控功能。[结论]在小麦背腹极性建立中，小麦TaYAB1与TaCRC基因可能在转录调控过程中发挥重要作用。 　　关键词小麦；YABBY基因家族；TaYAB1基因；TaCRC基因；生物信息学 　　中图分类号 S512.1文献标识码A文章编号1007-5739（2009）07-0139-03 　　 　　Bioinformatics Analysis of YABBY genes from wheat 　　ZHAO Wei 1SU Hong-yan 2WANG Lei 2 　　（1Institute of Agricultural Information Chinese Academy of Agricultural Sciences，Beijing 100081； 　　2 College of Life Sciences Yantai Normal University Yantai Shandong） 　　Abstract[Objective] This study aimed to conduct bioinformatics analysis of TaYAB1 and TaCRC in YABBY gene family from wheat. [Method] The physicochemical characteristics，structures and functions of TaYAB1 and TaCRC were predicted and analyzed with software tools and database. Meanwhile，the phylogenetic tree of TaYAB1 and TaCRC and related YABBY proteins was constructed. [Result] TaYAB1 and TaCRC are unstable hydrophilic proteins without transmembrane domains. They are located in nuclear and display several secondary structures. Function analysis predicted TaYAB1 and TaCRC have functions in transcription and transcription regulation.[Conclusion] TaYAB1 and TaCRC may play important roles in transcription and transcription regulation during the establishment of abaxial-adaxial polarity in wheat. 　　KeywordsWheat；YABBY gene family；TaYAB1；TaCRC；Bioinformatics 　　 　　在植物的生长发育过程中，从早期的胚胎发育至后期侧生器官的分化，极性的建立起着重要的作用。随着遗传学和分子生物学技术的发展，人们对植物极性建立分子机理的认识也深入到分子水平。背腹极性是植物侧生器官发育过程中建立的主要极性之一，YABBY基因家族在控制背腹极性建立中发挥重要作[1]。在拟南芥中已分离出6个YAB 基因家族成员：CRC、FIL（YAB1）、YAB2、YAB3、INNER NO OUTER（INO） 和YAB5[2-4]。此外，人们陆续从金鱼草、水稻等植物中分离出YABBY基因家族成员，这表明YABBY基因广泛地存在于双子叶植物与单子叶植物中[5-7]。 　　 　　虽然在双子叶植物拟南芥中关于背腹极性建立的分子机理取得了重要进展，然而在单子叶植物尤其是禾本科植物中所获得的涉及极性建立的突变体较少，因此关于单子叶植物的背腹极性建立的模式研究较少。小麦是主要的禾本科植物之一，同时也是重要的粮食作物，研究其极性建立具有非常重要的意义。为了研究小麦侧生器官极性建立的分子机理，笔者已经分别从小麦的小穗及心皮中分离出2个具有YABBY基因保守区域特征的基因成