桑青枯雷尔氏菌gsp G和gsp K基因获取与生物信息学分析.docVIP

桑青枯雷尔氏菌gsp G和gsp K基因获取与生物信息学分析 　　摘要： gsp G和gsp K参与青枯雷尔氏菌Ⅱ型分泌系统周质复合体的形成。本研究以桑青枯雷尔氏菌MR111为材料，利用PCR扩增和DNA测序技术成功获得其gsp G和gsp K基因438 bp和843 bp的序列，在线BLAST分析两个基因编码蛋白与其它青枯雷尔氏菌同源区域的相似性在90%以上。在线CDD分析两个蛋白除分别含有典型的T2SG和T2SK以及N端主要由亮氨酸和丙氨酸组成的分泌型信号肽外，gsp G还含Ⅳ型分泌系统的“Ⅳ_pilin_GFxxxE”结构，而在gsp K中则出现了重复的“GIQSTE”序列，该序列在雷尔氏菌属中高度保守。 　　关键词：桑树；青枯雷尔氏菌；Ⅱ型分泌系统；gsp基因 　　中图分类号：S432.4+2文献标识号：A文章编号：1001-4942（2015）03-0009-04 　　Acquisition and Bioinformatics Analysis of gsp G and gsp K Genes 　　of Ralstonia solanacearum from Mulberry 　　Zhuo Su， Kong Weiqing* 　　（College of Agriculture and Life Sciences， Ankang University/Key Sericultural Laboratory of Shaanxi， Ankang 725099， China） 　　Abstractgsp G and gsp K genes are involved in the formation of periplasmic complex of Ralstonia solanacearum type Ⅱ secretion system. The sequences of gsp G and gsp K genes of Ralstonia solanacearum strain MR111 with 438 bp and 843 bp in length respectively were obtained from mulberry by PCR amplication and DNA sequencing technology. By online BLAST analysis， the similarity of the 2 genes with the homologous genes from other R. solanacearum species were both over 90%. There were typical functional structure of T2SG and T2SK， and secretory signal peptide composed mainly by leucine and alanine in the N-end in the 2 genes， respectively. A type Ⅳ secretion system “Ⅳ_pilin_GFxxxE” structure was found in gsp G， and a repeat sequence “GIQSTE” was found in gsp K. This repeat sequence was highly conserved in R. solanacearum. 　　Key wordsMulberry； Ralstonia solanacearum； Type Ⅱ secretion system； gsp gene 　　植物病原细菌通过泌出毒性因子和各种酶类与寄主植物蛋白进行互作完成其侵染过程，并使寄主植物产生病斑、枯萎等病症[1]。目前病原细菌主要存在4种类型的分泌系统，Ⅰ型分泌系统主要分泌蛋白酶、毒素、脂肪酶等[2]；Ⅲ型分泌系统通过干扰抑制植物防御反应、调节寄主细胞的生理过程，帮助其对寄主的侵染，这两种分泌系统均是直接将底物蛋白从细胞质分泌到胞外[3]；Ⅳ型分泌系统被认为是接触依赖性系统，类似一个大的菌毛结构，横跨内外膜，使蛋白和大分子输出、靶定寄主细胞[4]；Ⅱ型分泌系统则主要分泌淀粉酶、蛋白酶、纤维素酶以及细胞毒素等，降解植物细胞壁并产生大量的胞外多糖，使植株导管阻塞，植物体内水分的运输受到阻碍，或引起过高的静水力学压力，导致导管破裂，最终引起植株萎蔫[5]。 　　青枯雷尔氏菌（Ralstonia solanacearum）能单独存活于土壤并在其中繁殖，可以从次生根的根冠部位直接侵入植物，致病性、致病机理复杂[6]。由该菌引起的植物青枯病可危害