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植物中miRNA及其靶基因检测与鉴定方法 　　摘 要 miRNAs（microRNA，微RNA）作为植物体内一类重要的内源性非编码小分子RNA，能够显著调控细胞发育的多个生物学过程，对植物生长起重要调控作用。诸多研究表明：在植物生长发育过程中miRNA的表达具有组织特异性和时空特异性。因此，检测和分析不同组织或样品中miRNA及其靶基因的种类与表达特征，可为研究miRNA的生物学功能提供重要信息和依据。本文综述了近年来植物中miRNA及其靶基因的检测与鉴定方法及其存在的优缺点，为进一步开展miRNA及其靶基因的功能研究提供借鉴和参考。 　　关键词 miRNA ；靶基因 ；检测方法 　　分类号 Q522 　　Detection and Identification of miRNAs and Their Target Genes in Plants 　　WEI Mingming LI Weiguo 　　（State Centre for Rubber Breeding / Ministry of Agriculture Key Laboratory of Biology and Genetic Resources of Rubber Tree / Rubber Research Institute， CATAS，Danzhou，Hainan 571737） 　　Abstract miRNAs， an important class of endogenous non-coding small RNA molecules in plants， can significantly regulate multiple biological processes of cell development and play an important role in plant growth regulation. Many studies show that the expression of miRNA in the process of plant growth has spatial and temporal specificity. Therefore，detection and analysis the characterization of miRNAs and their target genes in different tissues or samples can provide important information and basis for studying the biological function of miRNA. This paper discusses the detection and identification methods of miRNAs and their target genes in plants， as well as the advantages and disadvantages of different methods in recent years，so to provide the reference and instruction for further studying the function of miRNAs and their target genes. 　　Keywords miRNA ； target gene ； detection methods 　　对于小分子RNA的关注，始于2000年6月人类基因组计划的完成，该计划的完成向人类揭示了高等哺乳动物基因组中蛋白质编码序列不足2%，而98%以上的序列都是非蛋白质编码DNA[1]。此后，随着多种模式植物基因组测序的完成，科学家发现，非编码序列占绝大多数的情况同样存在于植物基因组中。起初许多学者将此类非蛋白编码基因认为是“垃圾DNA”，但随后研究发现，生物细胞所表达的RNA中，除了前人熟悉的tRNA、rRNA、mRNA外，还蕴藏着大量不编码蛋白质的非编码RNA分子（noncoding RNA，ncRNA），这些在生物体基因组上广泛分布的非蛋白质编码区并非“垃圾DNA”，而是包含了大量转录调控元件的非编码RNA基因[2]，它们能够调控真核细胞发育的多个方面，如影响功能基因的表达、调控细胞周期和个体发育等多种行为[3]。ncRNA的发现，打破了长期以来对RNA仅限于DNA的“转录信使”这一角色的认识，使科学家重新审视对细胞功能及其进化的认识。非编码RNA分子在多个物种中不断被发现和鉴定，揭示出了生物体内存在着一个巨大的且不为人知的“非编码RNA世界”。同时，基于不同物种体内非编码RNA分子