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猪STIM1基因变异筛选及其与产仔数性状关联分析
猪STIM1基因变异筛选及其与产仔数性状关联分析
摘要:猪的产仔数是繁殖性状中重要的经济性状。STIM1是一种钙离子结合蛋白,在卵母细胞成熟、受精以及胚胎早期发育过程中发挥重要作用。鉴定获得了猪STIM1基因内含子10中的1个新的突变位点g.199893-delT,采用直接测序法在DIV系和大白猪群体中进行了基因分型,并对产仔数性状进行了关联分析,结果发现该突变显著影响母猪的产仔数性状(P0.05)。NN基因型母猪总胎次的产仔数和产活仔数显著高于MM基因型(P0.05)。
关键词:猪;产仔数;STIM1基因;关联分析
中图分类号:S828;S813 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2015)24-6296-03
DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2015.24.051
Abstract: In pig production, litter size has been one of the most important economical traits.Stromal interaction molecule 1 (STIM1) was a transmembrane-spanning Ca2+-binding protein which was essential in oocytes maturation and fertilization, and early embryo development. In this study a novel mutation (g.199893-delT) at intron 10 in porcine STIM1 gene were identified by sequencing. Association results showed that it significantly affected the litter size traits in both DVI line and Large White pigs (P0.05). In all parities, the sows with NN genotype had significantly more piglets than that of MM genotype (P0.05).
Key words:pig; litter size;STIM1 gene;association analysis
猪的产仔数是繁殖性状中重要的经济性状,直接关系到养猪业的经济收益。提高猪产仔数对提高养猪业的总体经济效益意义重大。据统计,在中国如果母猪产仔数每胎增加1头,每年将增收190亿元的纯利[1]。母猪产仔数性状是一个由排卵、受精、着床、胎儿发育等多个具有时间顺序特征的组分性状构成的复合性状,属于遗传力很低(0.1左右)的数量性状,难以用常规育种技术进行遗传改良,所以寻找控制猪繁殖率的主效基因及其遗传标记对提高母猪产仔数具有重要意义。
STIM1(Stromal interaction molecule 1)基因参与调节胞内Ca2+浓度,在哺乳动物卵母细胞中表达,可能参与调节卵母细胞成熟和受精过程。STIM1蛋白能感受内质网内钙库Ca2+浓度,从而调节Ca2+内流,参与形成Ca2+释放激活Ca2+通道(CRAC),引发钙库控制的Ca2+内流(SOCE),调控膜内外的Ca2+浓度,与钙振荡相关[2-4]。而卵母细胞的减数分裂激活和成熟以及受精过程均受到钙振荡的调节[5,6]。2009年,Koh等[7]首次报道STIM1存在于哺乳动物卵母细胞中,并且在猪卵母细胞中STIM1能探测内质网Ca2+浓度,并触发SOCE。2012年最新研究表明,STIM1在鼠成熟卵母细胞中的表达量远高于未成熟卵母细胞,且仅在成熟卵母细胞中才能检测到SOCE[8]。精子刺激后,STIM1在小鼠卵母细胞中迅速迁移,并参与受精过程钙振荡的维持[9]。在秀丽新小杆线虫中发现,STIM1干扰后导致生殖腺形态异常,无法正常排卵,也无法受精[10],STIM1是秀丽新小杆线虫正常排卵和繁殖力所必需的[11]。另外,大量研究报道STIM1对肿瘤有抑制作用,如子宫颈癌[12]、乳腺癌[13]、卵巢癌[14]等。
综上所述,STIM1基因与动物繁殖性能有着密切联系,参与调控卵母细胞成熟及受精过程。目前猪STIM1基因对母猪产仔数的影响还未见报道,本研究筛选鉴定猪STIM1基因多态位点,并与产仔数性状进行关联分析,以期获得母猪产仔数相关的新分子标记。
1 材料与方法
1.1 试验样品
采集了24头梅山猪(湖北省英山县绿源养猪专业合作社)、174头大白猪(湖北省农
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