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耳聋基因芯片对耳聋高危人群检测临床意义.doc

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耳聋基因芯片对耳聋高危人群检测临床意义

耳聋基因芯片对耳聋高危人群检测临床意义   [摘要]目的分析耳聋高危人群检测中耳聋基因芯片的临床应用价值。方法方便选择该院2015年8月-2016年12月接收的耳聋患者120例,均应用耳聋基因芯片实施突变检测,观察检测结果。结果120例患者中,63例检出基因突变,检出率39.1%;63例检出基因突变患者中,重度耳聋38例,极重度耳聋25例;57例未检出基因突变患者中,重度耳聋50例,极重度耳聋7例。结论耳聋高危人群检测中,耳聋基因芯片的应用可提升检出率,降低耳聋发生率。   [关键词]耳聋基因芯片;耳聋高危人群;检测;临床意义   [中图分类号]R764 [文献标识码]A [文章编号]1674-0742(2017)10(a)-0055-03   耳聋在临床中比较常见,发病后不仅交流受到影响,而且生活?|量会严重降低。在耳聋患者中,0.1%~0.3%为新生儿。从致病原因看,由遗传因素导致的耳聋患者占据总数的50%以上。因耳聋存在高度的基因及位点遗传异质性,且相关于多个基因的突变,因而如采取传统检测4方法,仅能将同一基因同一位点检测出来,达不到筛查诊断要求。研究指出,耳聋高危人群检测中,耳聋基因芯片技术具有较高的应用价值,可与筛查诊断要求相符合。因此,该院以2015年8月-2016年12月接收的汉族耳聋患者120例为研究对象,探讨耳聋基因芯片的应用价值,现报道如下。   1资料与方法   1.1一般资料   方便选择新疆医科大学第一附属医院接收的汉族耳聋患者120例,男68例,女52例;年龄3个月~59岁,平均(32.7±6.4)岁。纳入标准:均符合耳聋诊断标准,患者及(或)家属均对该研究知情,且自愿参与研究。   1.2方法   研究人员调查记录患者发病年龄、家族史、疾病史等;所有患者均接受耳聋基因芯片(北京博奥生物有限公司)检测,检测步骤如下。   1.2.1标本采集与处理于患者肘静脉处采集血液标本5mL,置入采血管(EDTANa2抗凝)中,全血基因组DNA提取时,利用全血核酸提取试剂盒(天根生化公司),完成后在20℃冰箱中保存。   1.2.2PCR反应引物共8组,针对8个突变位点[GJB2基因(突变位点:35delG、176dell6/235delc、299-300de1AT),SLC26A4基因(突变位点:2168AG、IVS7-2AG),线粒体12rRNA基因(突变位点:1494CT、1555AG)],将其分为两个反应体系,分别标记为A、B,实施多重PCR,A、B反应体系各20μL,将100~200ng/μL浓度的待测全血基因组DNA加入其中,扩增引物混合物12.5μL,扩增试剂混合物4.5μL。PCR反应时,程序如下:37℃下,反应10min;温度提高至95℃,反应15min;温度再提高至96℃,进行1min预变性;之后温度降低至94℃,反应30s;继续降低至55℃,反应30s;提高到72℃,反应45s,循环共进行32个;降低至70℃,反应45s,最终降低至60℃,反应10min。反应期间,温度由94℃降低至55℃时,降低速度控制在0.4℃/s,而由55℃提高至70℃时,提升速度控制在0.2℃/s。   1.2.3杂交 95℃条件下,于金属浴中放置PCR产物,给予10min变性,完成后,迅速向冰水中放置PCR产物,冰浴3min。从A、B反应体系管中将相同标本取出,量均为25μL,向试管(内置杂交缓冲液10μL)中混入,混合均匀会,于芯片微阵列区域中加入,用盖玻片封闭杂交盒后,在预热杂交箱(50℃)中放置,进行1h保温。   1.2.4洗片 完成杂交后,取出芯片,在洗涤液I(42℃)中放置,之后通过摇床,进行2min洗涤,随后取出,并于洗涤液Ⅱ(42℃)中快速放人,再经摇床给予2min洗涤。结束后,在玻片架上放置芯片,利用离心机甩干液体,离心速度1200r/min,时间2min。   1.2.5芯片扫描 芯片扫描利用扫描仪进行,扫描仪采用晶芯LuxScanTM 10K/B微阵列芯片.激光扫描强度设置为90,激光波长选择532nm。   1.3观察指标   观察所有患者检测结果,同位点中,探针W信号表现为阳性时,位点属于野生型;探针M信号表现为阳性时,位点属于纯合突变型;探针W信号与探针M信号均表现为阳性时,位点属于杂合突变型。   2结果   120名患者中,63例检出基因突变,检出率39.1%,其中,48例GJB2基因突变携带者,15例SLC26A4基因突变携带者。48例GJB2基因突变携带者中,235delc纯合突变28例,235delC杂合突变16例,235delC/299-300delAT复合突变4例;15例SLC26A4基因突变携带者中,IVS7-2AG纯合突变8例,IV

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