癌症差异表达基因的似然比置换检验法-概率论与数理统计专业论文.docxVIP

浙旺大学硕士学位论文摘要 浙旺大学硕士学位论文 摘要 摘要 近年来，随着生物统计学特别是 DNA 微阵列(基因芯片)技术的蓬勃发展，料学家 们在生物、医药、疾病等领域取得了令人瞩目的成就.在生物统计学中，基因选择一直 以来便是囊耍的研究芋段. 攻克癌症是当今医学界的一个热点话题.当然，这也离不开差异表达基因的筛选.针 对癌症基因差异表达的特殊性，许多统计学家提出了新的统计量和检验方法，不断的在 这一领域取得突破和宪替.本文将在借鉴这些已有研究成果的基础上，活用统计学中两 种经典的常用方法，提出…种有效的手段……4以然比一置换检验法，用以瓢选癌症的提 异表达基因. 本文共分为丑事第一章介绍相关的背景知识，第二章给出文擎的核心…叶以然比 …置换检验的具体算法.第三章和第四章分别将此方法运用于模拟实验和一个具体的实 例中.第五章是对全文做出总结和一些相关的讨论. 关键词: DNA 微阵列(基因芯片) ，基因选择，似然比检验，置换检验. 浙江大学硕士学位论文A 浙江大学硕士学位论文 Ab现ract PAGE PAGE 2 Abstract With 甘旧伯st development of bios恼tistics咱specially 世回怡chnology of DNA Microarray(gene chip)，scientis怡 have ob恼ined remarkable achievement in 甘旧制ds of biology，medicine and disease. Gene selection has been an empha创?d research me仙。d in bios阳tistics. To overcome 甘赠阅阴阳， which has become a hot topic reω州y，also need gene se悟ction. S阳tisticians have succeeded in proposing new statistics and methods to solve 伽 problem of selecting differential expressed cancer gene. 币lis artic抽 will advance a new method called Likelihood ratioPermuta甘on Tesf， in order to select diffe阳ntial expressed ger晴s under the cancer model，after 世隐 referencing of some 创sti咽 research. W悔 whole artic怡 is divided into 5 chapters. A伽r a background i巾。duction in chapter 1，chapter 2 时11 advanω6晦 core method. In chapter 34，applications to simulation and a re创 examp胎 will be occured. At last we also have a sum-叩 and some 仙rt协r discussion in chapter 5. Key Words: DNA Microarray(Gene chips)，Gene selection，Likelihood ratio 阳st Permutation 协吼 第 1 第 1 章 浙江大学硕士学位论文 第 1 :章介绍 1.1 背景 惹异表达基囚的检测问题一直以来在生物科学领域中占据着重要的地位.近年来， DNA 微阵列技术 (microarra:，州一一又称为基因芯片 (gene c忡. )取得了令人瞩目的发展.这 项技术可以在同一时间对大量基因表达水平精确、快速的分析并予以记录，多以矩阵形 式 (x{)P 表示.其中 n代表样本容量 ，p 为基因数囊，通常布 p n[l]. 由于基因数量p 的庞大，人们不可能也没有必要对所有的基因进行研究，而是从成 千上万个基因中筛选出与某一特定疾病相关的基因，从而通过控制这些致病基因，以达 到控制疾病的目的问.那些在患病者的样本和正常人样本上表达有显著差异的基因，恨 自然的被认为向这…疾病有着明显的关系，即为致病基因.于是，如何利用生物统计学的 方法，从大量的基因中寻找出致病基因，将是生物统计学家需要研究的课题. 目前，差异表达基因的检测方法有很多，除了下文提到的最为常用的两样本 f 检验 外，很多统计学家针对不间的差异表达模型提出了新的方法并取得了很好的成效问.这 间基因表达的多样性是有关的.本文将要讨论的问题一一关