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长顺绿壳蛋鸡PRL基因克隆及序列分析
长顺绿壳蛋鸡PRL基因克隆及序列分析
摘要:采用特异性引物PCR技术获得长顺绿壳蛋鸡PRL基因,将其克隆至pGM-T载体,并对该序列进行测序分析。结果表明,长顺绿壳蛋鸡PRL基因全序列长度为690 bp,包含5个外显子和4个内含子,编码229个氨基酸。将长顺绿壳蛋鸡PRL基因与GenBank已公布的鸡、鸭、鹅、鱼等动物的PRL基因序列进行同源性比较,发现亲缘关系越远则同源性越低。
关键词:长顺绿壳蛋鸡;催乳素基因;克隆;序列分析
中图分类号: Q785文献标志码: A
文章编号:1002-1302(2016)12-0082-03
收稿日期:2015-10-13
基金?目:贵州省科学技术基金(编号:黔科合J字[2011]2174);贵州省农业科学院研究生创新基金(编号:黔农科合[创新基金]2010011);贵州省动植物育种专项(编号:黔农育专字[2011]027);贵州省农业科学院专项(编号:黔农科院院专项[2014]006号)。
作者简介:韩雪(1982―),女,江苏徐州人,硕士,助理研究员,主要从事动物遗传育种研究。E-mail:hanxue8855601@126.com。
通信作者:陶宇航,副研究员,主要从事家禽养殖研究。E-mail:1043694421@。
催乳素(prolactin,PRL)是动物垂体前叶嗜酸细胞分泌的一种多肽类激素,对哺乳动物的乳腺发育、泌乳、卵巢功能、维持妊娠、机体免疫等具有重要的生物学效应[1]。在家禽中,PRL是促进母禽就巢孵卵行为和调控生殖活动的关键激素[2],就巢期间PRL表达量升高可抑制垂体促性腺激素的分泌,致使卵巢萎缩,排卵泡停止,最终终止产蛋[3]。很多物种PRL基因的cDNA或基因全序列已被测定,其转录产物在不同物种中高度保守。对人、鸡、鸭、鹅等动物的研究表明,PRL基因由5个外显子和4个内含子构成。禽类PRL前体含229个氨基酸,其中包括30个氨基酸的信号肽序列和199个氨基酸的PRL成熟蛋白[4]。
长顺绿壳蛋鸡因其产地地处贵州省长顺县而得名,是中国稀有的珍禽品种。长顺绿壳蛋鸡是在贵州省特定自然生态环境下,经长期自然选择和人工选择而形成的品种,具有耐粗饲、抗病力强、觅食能力强等特点。然而,长顺绿壳蛋鸡产蛋量低、就巢性强,严重限制了其产业化发展。以长顺绿壳蛋鸡为研究对象,克隆其催乳素基因并进行测序分析,为长顺绿壳蛋鸡品种资源的保护利用及其产蛋性能的提高提供依据。
1材料与方法
1.1材料
血样采自贵州省长顺县长寨镇新民村长顺绿壳蛋鸡纯种繁殖场,翅静脉采血,共采取30羽长顺绿壳蛋鸡的血样。所有母鸡均在相同环境下单笼饲养,采取的血样经EDTA抗凝剂抗凝,送至实验室于-20 ℃保存备用。
1.2方法
1.2.1DNA提取
采用血液基因组DNA提取试剂盒(北京天根生化科技有限公司)提取血样中的DNA。
1.2.2引物设计
根据GenBank已公布的禽、鼠等PRL基因序列,采用Primer 5.0软件在序列保守区设计引物,引物序列见表1,由北京鼎国生物技术有限公司合成。
1.2.3PCR扩增与测序
50 μL PCR反应体系为10×PCR Buffer 5 μL、dNTP(10 μm) 1 μL、Template 1 μL、primer-F(10 μm) 1 μL、primer-R(10 μm) 1 μL、rTaqDNA聚合酶(2 U/μL) 0.5 μL,最后采用ddH2O补足至50 μL。PCR反应条件为95 ℃预变性5 min;95 ℃变性30 s,52~47 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,共50个循环;72 ℃延伸10 min,4 ℃保存。PCR产物采用0.8%琼脂糖凝胶电泳检测后,送至北京鼎国生物技术有限公司进行克隆和测序。
1.3数据处理
将PRL基因5个外显子片段进行拼接,并采用GenBank数据库进行BLAST分析。同时,将cDNA序列翻译成氨基酸序列,确定正确的开放阅读框(open readingf rame,ORF);采用DNAman软件()对长顺绿壳蛋鸡PRL基因序列与GenBank数据库公布的其他动物PRL基因序列进行核苷酸、氨基酸序列同源性比较及生物信息学分析。
2结果与分析
2.1长顺绿壳蛋鸡PRL基因的PCR扩增
以长顺绿壳蛋鸡血总DNA为模板,利用5对特异引物分别进行PCR扩增,扩增产物与预期片段大小吻合,引物扩增结果见图1。
2.2重组质粒的酶切鉴定
将重组质粒导入大肠杆菌,经过蓝白斑和抗性筛选,提取阳性大肠杆菌并进行质粒提取,然后对质粒进行EcoRⅠ酶切鉴定。结果表明,重组质粒构建成
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