CircRNA 研究进展综述-2017年.pptx

CircRNA 研究进展分享;目录;CircRNA;CircRNA; 功能：circRNA顺式调控亲本基因的表达 ; 功能：海绵作用 ; 功能：编码蛋白质 ; 形成机制 ; 哈佛医学院 Salmena 等于 2011 年 7 月提出了着名的 ceRNA 调控假说。 该假说认为： ceRNA 的生物 学 功 能 是 通 过 miRNA 应 答 元 件 （ miRNAresponse element,MRE） 完成的，ceRNA 具有数量和种类不等的 MRE,可以竞争性地结合 miRNA,降低miRNA 对其靶标的抑制作用，也就是 miRNA 的海绵作用。 2012年第一篇环状RNA文章（Salzman，2012）发表，Salzman通过RNA-Seq方法首次报道了80个环状RNA。至此借助于高通量测序技术，环状RNA(circular RNA)验明正身进入科研视界，送出了来自这一环状宇宙的第一份信函 Jeck 等在人类成纤维细胞中检测出了高达 25000 多种的circRNA；而Memczak等通过RNA-seq 数据结合人白细胞数据库鉴定出 1950种人类circRNA、1903种小鼠circRNA (其中81种与人类circRNA相同) 和724种线虫circRNA Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency.Nature.Year published:(2013)DOI:doi:10.1038/nature11928 2013年Rajewsky教授曾在Nature上发表文章指出，circRNA具有microRNA海绵的作用，可以结合并抑制microRNA的活性，进而调控microRNA靶标发挥作用。atural RNA circles function as efficient microRNA sponges.NatureYear published:(2013)DOI:doi:10.1038/nature11993 2013年9月12日中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲组与计算生物所杨力组合作，在《Molecular Cell》（IF:14.08）上发表 Circular Intronic Long Noncoding RNAs ；构成、细胞定位、成环机制、功能机理 2015年2月的《Nature Structural Molecular Biology》（IF:13.30）中国科学技术大学单革实验室报导了其发现的一类新型非编码RNA以及此类非编码RNA的功能机理 Exon-intron circular RNAs regulate transcription in the nucleus 德国Max Delbrück分子医学中心Cell子刊发布环状RNA的表达图谱为人们提供了一个哺乳动物大脑的circRNA表达图谱，证明circRNA在大脑中起到了重要的作用，具有成为生物学指标的价值Circular RNAs in the Mammalian Brain Are Highly Abundant, Conserved, and Dynamically Expresse 2017年3月以来Cell Research、Molecular Cell等杂志接连报道了3篇内源性circRNA可以翻译蛋白质的研究,但对翻译的新蛋白生物学???能和分子调控机制仍不清楚。 ;CirlRNA文章典型案例分析;重点关注以下三点： 1、如何筛选和确定目标circRNA分子？ 2、如何推测和证实circRNA翻译蛋白质？ 3、如何研究circRNA翻译蛋白质的生物学机制？;重点关注以下三点： 1、如何筛选和确定目标circRNA分子？ 2、如何推测和证实circRNA翻译蛋白质？ 3、如何研究circRNA翻译蛋白质的生物学机制？;CircRNA文章典型案例分析;mapping;2. CIRCexplorer 这款工具是在2014年随着 Complementary Sequence-Mediated Exon Circularization 的发布而问世，被誉为2014年RNA测序领域最值得一读的文章之一！2016年新版本CIRCexplorer2;2. CIRCexplorer 这款工具是在2014年随着 Complementary Sequence-Mediated Exon Circularization 的发布而问世，被誉为2014年RNA测序领域最值得一读的文章之一！2016年新版本CIRCexplorer2;CircRNA目前生物信息分析流程比较; 建库 ; 建库 ; 数据量 ; 分析流程 ;CircRNA 未