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大豆转录组测序的研究进展综述 　　摘 要：大豆是世界上最重要的油料作物之一，同时也是人类食物和动物饲料的主要来源。随着第二代基因组高通量测序技术的广泛应用，录组组测序技术的迅猛发展给生物基因组学的研究带来了深刻的影响。转录组研究能够从整体水平研究基因功能和基因结构揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理。该文主要简述了转录组测序主要方法及其在大豆研究中的应用，为今后该技术的研究与应用提供参考。 　　关键词：大豆；转录组；高通量测序技术 　　中图分类号 S511.2+2 文献标识码 A 文章编号 1007-7731（2015）08-17-05 　　Research Status of Soybean Transcriptome Sequencing 　　Liu Jiawei1 et al. 　　（1College of Life Sciences，Jilin Agricultural University，Jilin 130118，China） 　　Abstract：Soybean is one of the worlds most important oil crops，also is the main source of human food and animal feed.As the second generation of high-throughput genome sequencing technology widespread application，the rapid development of sequencing technology has brought the profound influence on biological genomics research.From the overall level of gene function and gene structure，transcriptome research revealed the specific molecular mechanism in the process of biological processes and disease.This article mainly introduced the transcriptome sequencing of main methods and its application in soybean research，providing a reference for future research and application of the technology. 　　Key words：Soybean；Transcriptome；High-throughput sequencing 　　转录组（Transcriptome）的概念最早是由Velculescu等于1995年提出，广义上讲转录组是指在某一生理条件下细胞内所有转录产物的总和，包括mRNA（编码RNA）和tRNA、rRNA、snRNA等非编码RNA；狭义上讲是指所有mRNA的总和。与基因组具有静态实体的特点不同，转录组的表达具有动态性，它既受外源因子的影响也受内源因子的调控，可以准确反映出生物个体特定细胞、组织和器官在某一特定生长发育阶段细胞中所有表达基因的水平；同时也可以用来比较不同组织或不同生理条件下基因表达的差异，发现与特定生理功能相关的新基因，并预测未知基因。目前转录组测序技术已广泛应用于医学和农业科学等基础研究领域。RNA测序可以产生基因表达的大量信息，并避免DNA微矩阵分析方法的许多固有的缺陷，随着拟南芥、水稻、棉花、马铃薯、玉米、大豆等植物的全基因组测序的完成，越来越多的研究者使用RNA测序技术研究不同环境条件下或不同生长发育阶段植物的基因表达模式，为理解基因表达调控机制以及挖掘与特定性状相关的候选基因提供大量重要的信息。本文对近年来大豆转录组学研究进展进行了综述，为转录组测序技术在大豆以及其他动植物中的应用提供可借鉴的依据。 　　1 高通量测序技术平台 　　使用很多不同的方法对所得到的基因进行测序和基因的比对，最主要的目的是能够得到细胞内基因的时空表达模式。DNA的测序方法，例如降解方法是随着 DNA双螺旋结构被发现之后相继出现的，当时的DNA测序方法操作起来比较复杂，因而在科学领域并没有形成规模化的生产和应用实验。Sanger等成功的于1977年构建起的测序方法是链终止法，也被称之为双脱氧测序法或Sanger测序，随着该测序方法的出现，DNA的测序成功的迈向了规模化与实用化的道路。但该测序方法也存在着测序通量较低，测序的过程比较复杂，耗费时间和精力的缺点。随着罗氏公司的焦磷酸