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天津市科技发展计划项目申请书(科技攻关重点项目)教学讲义.ppt
王世鑫
武警医学院科研部
武警医学院蛋白质组学实验室
;2、黑色系统;3、灰色系统;(二)白色、黑色和灰色系统间的相互关系;(三)统计学是进出白色和和黑色系统的钥匙;二、整体、系统的思维方式;系统生物学——全球发展热点; 系统生物学将是21世纪医学和生物学的核心驱动力。;; 系统生物学的灵魂就是整合性思维方法,是指研究思路和方法的整合。和以往科学研究的区别:
—经典的分子生物学研究是一种垂直型的研究。
即采用多种手段研究个别的基因和蛋白质。首先是在DNA水平上寻找特定的基因,然后通过基因突变、基因剔除等手段研究基因的功能;在基因研究的基础上,研究蛋白质的空间结构,蛋白质的修饰以及蛋白质间的相互作用等等。
—基因组学、蛋白质组学和其他各种“组学”则是水平型研究。
即以单一的手段同时研究成千上万个基因或蛋白质。;系统生物学——整合性的研究方法; 系统生物学的思维特点,则是要把水平型研究和垂直型研究整合起来,成为一种“三维”的研究。
此外,系统生物学还是典型的多学科交叉研究,它需要生命科学、信息科学、数学、计算机科学等各种学科的共同参与。系统生物学研究所的第一篇研究论文,就是整合酵母的基因组分析和蛋白质组分析,研究酵母的代谢网络。;;VEGF protein is secreted outside the cells and binds to its receptor on the endothelial cells to promote their growth.;
;一、创新的意义;二、创新度评价(理论);从科学计量学上,科技成果论文检索的重复率曲线(D)和论文检索的引用率曲线(S)之间在坐标系里必然存在一个均衡点。我们可以根据这个均衡点和均衡状态评价科技成果创新的程度。; 根据以上科技创新的一般均衡曲线可以看出以下几种情况:
(1)从一般均衡曲线上可以看到,E点以上部位的科研成果,由于其重复率小、引用率大,因此,其科技创新性就强,科技成果价值就大。反之,在E点以下,其创新性就弱,科技价值就小。
(2)当某项科研成果其重复率为零时,其科技成果引用率即反映出其创新程度;当其引用率为零时,其重复率即反映出其创新程度。
(3)当某项科技成果的重复率和引用率都为零时,表明此项科技成果的创新度为零。
(4)衡量科技成果创新度(科技价值)的大小既取决于其科技成果重复率大小,也取决于其科技成果引用率大小。重复率和引用率可以看成是科技研究领域非常重要的两种基本力量,它们之间的相互作用决定了科技成果创新性的大小。;
;第三节 临床蛋白质组学;人类基因组计划;Many Genome;Eukaryotic cells is more like six to eight protein per gene
maybe several hundred thousand human proteins after splice variants and essential posttranslational modification
;蛋白质的多样性;Proteome;mRNA Expression;Differential Expression at Differential temperature ;Proteomics;蛋白质组学包括:;Structural Genomics
DNA;;VEGF protein is secreted outside the cells and binds to its receptor on the endothelial cells to promote their growth.;一条是力图“查清”人类大约3万到4万多基因编码的所有蛋白质,建立蛋白质组数据库,即组成蛋白质组学;另一条途径,则是着重于寻找和筛选引起2个样本之间的差异蛋白质谱,揭示细胞生理和病理状态的进程与本质,以及细胞调控机制,同
时获得对某些关键蛋白的定性和功能
分析,即比较蛋白质组学研究。; 这是一种针对有基因组或转录组数据库的生物体或组织、细胞,建立其蛋白质或亚蛋白质组(或蛋白质表达谱)及其蛋白质组连锁群的一种全景式的蛋白组学研究,从而获得对生命活动的全景式认识。
但目前在短时间内建立人类蛋
白质组学“完整的”数据库和实现网
络资源共享的条件尚未成熟。;虽然在微生物中,基因组、转录组基础上的蛋白质全谱研究已有成功报道,但在高等生物尤其是哺乳动物中未见报道,人类组织或细胞的蛋白质组全谱刚刚起步(肝)。开
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