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凡纳滨对虾选育群体遗传多样性分析-水产养殖专业论文
凡纳滨对虾选育群体遗传多样性分析
摘要
南美白对虾,学名为凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei),是迄今世界养殖产量 最高的优良虾种之一,也是目前我国主要对虾养殖品种。我国每年凡纳滨对虾苗种及 亲虾需求量巨大,然而,由于凡纳滨对虾是外来品种,其种质受到美国等育种机构的 垄断,我国每年需要大量的资金引进国外良种。我国凡纳滨对虾自主选育品种仍处在 选育研发和推广阶段,在新品种培育方面已培育出四个新品种,但与进口品相比,国 内新品种的市场竞争力不高,根本的原因在于我国缺乏种质资源库的支撑。可见,采 用遗传多样性丰富的基础群体培育适合我国养殖环境的南美白对虾育种是我国对虾 养殖产业持续稳定发展的必然趋势。在品种选育过程中,必须在掌握基础群体遗传背 景的前提下,才能充分利用杂种优势原理加快育种进程。本课题以凡纳滨对虾多个引 进群体与国内已培育的几个新品种为研究对象,采用 SSR 和 AFLP 分子标记技术对 不同群体的遗传多样性和遗传差异进行分析,同时采用 6 对 SSR 标记对凡纳滨对虾 2 个进口群体及其双列杂交产生的 4 个 F1 代进行遗传多样性及遗传差异进行分析,旨 在为凡纳滨对虾进一步的种质改良提供基础数据,为凡纳滨对虾的杂交优势利用提供 借鉴与参考。主要研究结果如下:
1、利用 SSR 标记分析 4 个引进群体(科纳湾(KONAB)、迈阿密(SISMAM)、 夏威夷(OI)及泰国正大(CHAI)群体)与 3 个国内养殖群体(―中兴 1 号‖(ZX)、
―中科 1 号‖(ZK)及广东海洋大学遗传育种中心(GDOU)群体)的遗传多样性及其
遗传差异。7 个位点在 7 个群体中共检测到 97 个等位基因,每个位点的等位基因数 范围介于 5~23,平均数为 13.867,所有群体的平均有效等位基因为 2.215~4.804。各 群体的观测杂合度和期望杂合度的范围分别为 0.372~0.631 和 553~0.751。基于等位 基因数和杂合度可看出,各个选育群体的遗传变异较大,整体遗传多样性水平较高, 国 内 养 殖 群 体 的遗 传多 样 性 高 于 引 进群 体。 各 群 体 的 固 定系数 DH-W 的范围为
-0.092~0.364 (均值 DH-W = 0.123)。AMOVA 分析结果显示,78.45%的遗传变异来源于
群体内,21.55%变异来源于群体间,各群体间的 FST 值在 0.113 ~0.314 之间(P 0.01), 表明各群体间存在极显著的遗传差异。
2、采用 AFLP 标记技术分析 7 个选育群体的遗传多样性及遗传差异。利用 7 对 选择性引物对 7 个群体 210 个个体进行扩增,在 100~500bp 之间共检测到 105 个 DNA 片段,其中多态条带为 90 个,多态位点比例为 85.71%;各群体的多态位点百分率和 平均期望杂合度分别为:54.17%~65.63% 和 0.164~0.236,平均值分别为:60.53%和 0.202,表明所检测的 7 个群体均具有较高的遗传多样性。AMOVA 分析显示:51.79%
I
的变异来源于群体间,群体的平均 ΦST 值为 0.518 (P0.001),表明各群体间存在显著
的遗传分化。
3、采用 6 对 SSR 标记对凡纳滨对虾 2 个进口群体(迈阿密(SIS)和泰国正大
(CHAI)群体)及其完全双列杂交产生 F1 代 4 个交配组合进行遗传多样性及遗传差 异分析。6 个 SSR 位点在 6 个群体中共检测出 25 个等位基因,每个位点的等位基因 数在 3~6 之间,平均为 4.328,平均有效等位基因数(Ne)为 2.675, 6 个群体中的 平均观测杂合度(Ho)与平均期望杂合度(He)分别介于 0.468~0.609 和 0.465~0.698 之间;各群体的多态信息含量(PIC)值介于 0.468~0.646 之间。2 个亲本与其 F1 代 之间的 FST 值范围在 0.080~0.421 之间,AMOVA 分析表明各群体之间的遗传差异极 显著(P0.01)。2 个杂交组的 F1 代群体的杂合水平均高于亲本群体,而 2 个自交组 的 F1 代群体的杂合水平稍低于亲本群体;杂交使后代的遗传变异水平升高,具有较 高的选育潜力,亲本 SIS 和 CHAI 存在一定程度的遗传分化。
关键词:凡纳滨对虾,遗传多样性,遗传差异,SSR,AFLP
Analysis of Genetic Diversity of Selected Stocks of
Litopenaeus Vannamei
Abstract
Pacific white shrimp, Litopenaeus vannamei, the worlds highe
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