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Z3HAV1生物学信息分析.doc
ZC3HAV1生物学信息分析
2006级本硕1班陈进昌
指导老师：吴炳礼，许丽艳，李恩民
ZC3HAV1 概况:
染色体定位：chr7q34
全长：902 AA
分子量：101444 Da
等电点：8.35
蛋白在细胞内的定位：核内/核外在69-76存在一个类似Nuclear localization signal 的序列 RARVCRRK ,而在 285-292 存在一个类似 Nuclear export signal 序列 LEDAPVDD
ZC3HAV1分子量和等电点随磷酸化修饰而变化
# Phosphates
Molecular Weight
Isoelectric Point
0
101485. 7061
8.68
1
101563. 6701
8.60
2
101641.6341
8. 51
3
101719. 5981
8.40
4
101797. 5621
8.27
5
101875. 5261
8. 13
6
101953. 4901
7.95
7
102031.4541
7. 76
8
102109.4181
7. 56
二.蛋白功能域分析
InterProScan Results
Table View Raw Output XML Output Original Sequences SUBMIT AHOTHER JOB
Inter Pro
iDPnnn^74
Zinc finger, CCCH-type
Domain
PF00642
zf-CCCH
IncerPro
SEQUENCE： Sequence 1 CRC64:687A7E8621AFB890 LENGTH： 902 aa
Inter Pro
IPR012317
Poly{ADP-iihose) polymerase, legion
Domain
PF00644 1 卜 PARP
IncerPro
nolPR
unintegrated
unintegrated
G3DSA:0
no
description
PTHR14453
PARP/ZINC
FINGER
CCCH TYPE DOMAIN CONTAINING PROTEIN
PTHR14453:SF16
ZINC FINGER CCCH TYPE ANTIVRAL PROTEIN 1 (RZAP)
结果表明该棊因除丫一个锌指motif,还含有一个PARP的功能域。
三.信号肽分析
SignalP-HMM prediction euk models)2 2C3HAV11.0
SignalP-HMM prediction euk models)2 2C3HAV1
1.0
0.8
0.6
0.4
0.2
0.0
MADPEVCCFITKILCAHGGRHALDALLQEIALSEPQLCEVLQVAGPDRFVVLETGGEAGITRSVVATTR
I
Cleauage prob.
-
h—region prob-
20 30 40 50
Position
60
76
结果表明，该基因没有信号肽序列。
U!N
U!
N型糖基化修饰预测
MADPEVCCFITKILCAHGGRMALDALLQEIALSEPQLCEVLQVAGPDRFWLETGGEAGITRSWATTRARVCRRKYCQR 80 PCDNLHLCKLNLLGRCNYSQSERNLCKYSHEVLSEENFKVLKNHELSGLNKEELAVLLLQSDPFFNTEICKSYKGEGRQQ 160 ICNQQPPCSRLHICDHFTRGNCRFPNCLRSHNLMDRKVLAIMREHGLNPDVVQNIQDICNSKHMQKNPPGPRAPSSHRRN 240 MAYRARSKSRDRFFQGSQEFLASASASAERSCTPSPDQISHRASLEDAPVDDLTRKFTYLGSQDRARPPSGSSKATDLGG 320 TSQAGTSQRFLENGSQEDLLHGNPGSTYLASNSTSAPNWKSLTSWTNDQGARRKTVFSPTLPAARSSLGSLQTPEAVTTR 400 KGTGLLSSDYRIINGKSGTQDIQPGPLFNNNADGVATDITSTRSLNYKSTSSGHREISSPRIQDAGPASRDVQATGRIAD 480 DADPRVALVNDSLSDVTSTTSSRVDDHDSEEICLDHLCKGCPLNGSCSKVHFHLPYRWQMLIGKTWTDFEHMETIEKGYC 560 NPGIHLCSVGSYTINFRVMSCDSFPIRRLSTPSSVTKPANSVFTTKWIWYWKNESGTWIQYGEEKDKRKNSNVDSSYLES 640 LYQSCPRGVVPFQA
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