- 1、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
潮汕贲门癌患者父系遗传背景及HLAⅠ类分子特征分析-病理学与病理生理学专业论文
学位论文知识产权声明
本人在就读研究生期间所完成的学位论文以及相关结果,知识产权归属 汕头大学医学院。本人在毕业离校前会将有关的研究资料和结果全部上交导 师,离校后发表或使用学位论文或与学位论文直接相关的学术论文或成果时, 须征得导师及导师所在单位 的同意,并要求署名单位仍为汕头大学 医学院。 本人不得以本论文的研究成果申报研究课题。导师和导师单位可以将学位论 文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描 等复制手段进行保存、汇编学位论文,可以公布(包括刊登)论文的全部或 部分内容。导师及导师所在单位享有发表学位论文、申请成果和专利的权利。
注:保密的学位论文在解密后适用本声明。
研究生签名 : 圳 ik B : 坠年 月 一日
导师签名 :廿仁 口期:M主年 -LLL一日
汕头大学医学院博士学位论文
中文摘要
背景
南方沿海潮汕地区、福建闽南地区和北方内陆河南太行山区,地理位置相距遥远,生 活环境迥异,却同为我国的贲门癌高发区。据历史记载,现今潮汕人群的祖先大多为中原 内陆居民(河南和山西)途经福建闽南迁入潮汕。因此我们推测潮汕与河南贲门癌患者可 能具有相似的遗传背景。编码人类白细胞抗原Ⅰ类分子(HLAⅠ类分子)复合体的基因具 有高度的多态性,其等位基因分布、单倍型组成及频率在不同人种和地区有明显不同。恶 性肿瘤的发生与 HLAⅠ类分子基因多态性及抗原表达异常有关。
目的
1. 利用父系遗传标记 Y-SNP 和 Y-STR 从群体遗传学水平证实潮汕与河南两大贲门癌高发 区贲门癌患者间存在较近的亲缘关系。
2.发现潮汕贲门癌患者 HLAⅠ类分子基因的体细胞突变及表达特征。
材料与方法 1.材料
1)血样:共 316 份。潮汕贲门癌患者(48 份),潮汕食管癌患者(73 份);潮汕客家人
(32 份);潮汕凤凰山畲族原住民(24 份);河南贲门癌患者(64 份),河南食管癌患者(48 份);新疆哈萨克族食管癌、贲门癌高危人群(27 份)。
2)组织标本:测序标本:45 例潮汕贲门癌新鲜病理组织标本; 免疫组织化学标本:51 例配对的贲门癌、癌旁组织及切缘组织的石蜡切片。 2.方法
1).基因分型:选取 16 个具有东亚人群特异性的 Y-SNP 及 7 个 Y-STR 位点进行研究。Y-SNP 标记应用高通量 SNP 分型平台 MassARRAY 时间飞行质谱生物芯片系统 iPLEX Gold 模块
(Sequenom Inc.)进行基因分型;部分标本应用 ABI 3730xl 测序仪和 PCR-RFLP 方法进 行验证和补充;对于 SNP 位点 M1,利用琼脂糖凝胶电泳分型。对 7 个 STR 位点先进行荧光 PCR 扩增,再利用 ABI 3730xl 测序仪毛细管电泳检测分型。
I
汕头大学医学院博士学位论文
2).SNP 分析:根据每个个体的 SNP 分型结果及 Y 染色体国际命名委员会的命名原则,确定
每个个体的单倍群,分析它们在四个研究人群中的频率分布并进行卡方检验。直接计算 SNP 基因型及单倍群多态性,并进行分层聚类、主成分分析及相关分析分析。
3).STR 分析:根据每个个体 7 个 Y-STR 的分型结果,计算 STR 单倍型频率。与比对资料一 起进行分层聚类、主成分、及相关分析,利用 Arlequin3.0 软件计算群体间的遗传距离, 然后再用 Mega2.1 软件构建 N-J 邻接树。绘制 O3a3c1*单倍群的网络结构图。
4).Sanger 测序:对贲门癌组织标本进行 HLA-A 易感位点及其邻近区域直接测序。
5).免疫组织化学染色:检测 HLA-A、HLA-B、HLA-C 在潮汕贲门癌癌变过程不同病变阶段 的表达情况。
结果
1.SNP 单倍群频率分布差异:潮汕贲门癌患者的 Y-SNP 单倍群主要分布在 O3*、O3a3c1*及 O1a*,河南贲门癌患者频率集中分布在 O3*、O3a3c*及 O3a1。O3*、O3a3c*及 O3a3c1*是东 亚北部人群的特征性单倍群,均具有 M122-C 突变,故可将这三个单倍群的频率合并分析。 这三个单倍群在潮汕贲门癌患者、河南贲门癌患者、河南、福建及潮汕食管癌、贲门癌高 危人群中的合计频率分别为 60.42%、63.49%、60.42%、66.21%和 65.16%,差别无统计学 意义,在凤凰山畲族人群的合计频率为 37.5%,明显低于贲门癌患者和高危人群。O1a*在 潮汕客家人群的分布频率为 43.75%,明显高于潮汕贲门癌患者,该单倍群在凤凰山畲族人 群中的分布频率也较高。新疆哈萨克族高危人群的多态性集中在 O*、F*/M*和 K*单倍群, 而未检出有其他单倍群多态性。
2.SNP 多态性统计分析结果:Y-SNP 分层聚类分析显示潮
您可能关注的文档
- 沉管隧道节段接头力学行为试验研究与理论分析-桥梁与隧道工程专业论文.docx
- 沉默ADAM10基因后Hela细胞生物学活性的改变及其可能作用机制的分析-生物化学与分子生物学专业论文.docx
- 沉管隧道节段接头剪力键结构形式与力学特性研究-桥梁与隧道工程专业论文.docx
- 沉默 CD55基因对胰腺癌生物学行为的影响-普通外科专业论文.docx
- 沉默ADAM10基因后Hela细胞生物学活性的改变及其可能作用机制的研究-生物化学与分子生物学专业论文.docx
- 沉默Bmi1基因增强胰腺癌细胞对吉西他滨的敏感性的实验研究-外科学(普外)专业论文.docx
- 沉降炉中煤与生物质混燃燃烧特性及NOx排放特性试验研究-热能工程专业论文.docx
- 沉默GRP94表达对肺癌A549细胞增殖能力的影响-外科学(胸心外科)专业论文.docx
- 沉香抗菌活性成分的研究-中药学专业论文.docx
- 沉默CYP3A4基因对人肝癌细胞增殖及遗传物质稳定性的影响-细胞生物学专业论文.docx
原创力文档


文档评论(0)