蛋白质变性的吸附动力学研究-理论物理专业论文.docxVIP

摘 要 ， 俗文山两个部分组成 前四章构成论文的第 一部分，内容主要涉及蛋白质变性现象的研究 ;第二部分为论文的 第五章，讨论内容是血红蛋白分子氧合过程的构象变化特性 - i J 首先，通过对典型单结构域蛋臼质尿素变性实验结果的分析，发现在蛋白质变性研究领 域中普遍使用的二态模型假说所描述的过程， 与真实 单结构域蛋 白质变性过程并不相符.在 分析己有的尿素诱导的蛋白质变性实验结果的基础上，给出了能够反映尿素诱导蛋白质变性 过程特征的新表示形式 - 1这一形式表明蛋白质变性是一-个构象渐变的过程 .利用吸 附反应动 力学方法， 在分子水平上得到 了可措地蛋白质变性过程特征的物理参量 y 与尿素浓度 L 之间 关系的表示式. 将从模型出发所得理论值与实验值进行比较发现两者符合较好， 表明建立 的 模型可较好地描述尿素诱导的单结构域蛋白质变性现象，同时又给出了从理论模型所得出的 某些预测和推论.· 其次，盐酸肌是常用于使蛋白质变性的另 一种重要变性剂，盐酸版分子与蛋白质分子相 互作用的机理和尿 素的情形 具有相似性.通过对典型的 S 形变性曲线与二态模型 之间的关 系 所作的详细分析，进一步强调变性过程表现为 S 型曲线，并非说明单结构域蛋白质的变性过 程一定是 二念过程.提出了挝酸肌分子与蛋白质分子主链上相邻的 二肤形成双氢键的作用机 理假设，同样利用吸附反应动力学方法，导出了叮描述甜酸肌诱 导的单结构域蛋 白质变性过 / 程的关系式，并对典型的归故酸肌诱导的单结构域蛋白质变性过程进行了分析。 分析结果表 明理论模型可以较好地解释实验事实.另外，从理论模型边可以给出了二些新的预测结果 . ? 第三，从构象 渐变的观点对蛋白质热变性现象进行了系统分析求现以前用 二态模型假 ? 说无法解释的实验结果，可以用构象渐变模型做出合理的解释.鉴 于蛋 白质变性过程的构象 变化特点，通过热变性实验所预测的结果，可用来进一步验证热变性过程具有构象渐变的特 性俨 第四，由蛋白质变性的构象渐变模型分析 多结构域蛋白质变性过程的特点惆吸附动力 学方法得到了可描述多个结构域变性的表示式，特别对典型双结构域蛋白质变性过 程予 以较 详细的讨论.在 一定参数条件下，用上述理论模型解释了双结构域蛋白质变性过程中出现，双 S 形变性曲线的原因， 1ft]IHx才变性过程中可能 HJ fJQ.(fJ 一些悄况边行了预测和分tJf..: i注后，在分机血红蛋 白分子与氧结合的机 lli 作时特点的基础上，将氧分子与血红蛋白分 ， 子结合的过程看作为协同可边吸附过程.  / (根据吸附过程的特点，利用  I吸附i}JJ力学方法，得到 了反映血红蛋白分子 氧合过程的氧饱合分数与氧分庄之间的关系式.从上述关系式 得到了与 之自治的推论，在一定的氧分 压条件下，血红蛋 白分子处于确定的部分氧合构象态. 当氧分压 的值从小到大变化时，血红蛋白分子将从脱 氧构象:态经历 一系列中 rélj 构象态到达完全氧合构 象态.这表明 S 形的氧合曲线实际显示了单个血红蛋 白分子的别构效应.[ / ? ， 关键词:蛋 臼质变性，二念模型，构象渐变，吸附动力学 ‘ ? JI ， 内兹古人学博 1 .学位论文 第一章尿素诱导的蛋白质变性现象的研究 ， 1. 引言 蛋白质分子较易受外界因素影响而发生构象变化，导致活性丧失、物理、化 学性质发生异常变化，这一过程称为蛋白质变性.众所周知，蛋白质分子在行 使生物功能时，必须具有特定的三维空间结构，蛋白质变性时蛋白质肤链伸展 而失去特定的空间结构.若除去变性因素后，很多变性蛋白质 可以自发地恢复 、 原有的空间结构和生物活性，这一过程称为变性蛋白质的复性或重折叠过程.研 4蝇 究蛋白质变性和重折叠过程的变化规律，可以深入了解维持蛋白质高级结构的 作用力所起的作用，对理解蛋白质天然结构的形成过程，即具有一定氨基酸序 列的多肤链是如何逐步卷曲折叠形成蛋臼质特有的空间结构，共有重大的理论 研究意义. 使蛋白质变性的方法有许多种，常用的方法有添加变性剂和对蛋白质溶液 加温促使蛋白质变性.可以用作变性剂的化学物质有多种，不同的变性剂对蛋 白质变性所产生的变性效果及作用机理 般不同，常用的变性剂主要有两种: ( 1 )尿素 Urea; (2) 盐酸肌 GuHCl.以往对由变性剂产生的蛋白质变性问题， 从理论方面对蛋白质与变性剂分子柑互作用机理的讨论很少涉及，绝大多数方 法是采用由实验结果出发的半经验公式进行分析 IMl，实际中常用的有以下三种 方法:第一种是由 Tanford 提出的.使用这种方法主要考虑到蛋白质完全解折叠 时，组成蛋白质肤链的各个残基的所有 基因将从水中移至变性剂溶液中，这时 其自由能将发生改变，利用