现代分值子生物学-其他进展.pptVIP

其它进展 合成生物学： Review Warren C. Ruder, Ting Lu, James J. Collins. Synthetic Biology Moving into the Clinic. Science 2011，333：1248-1252 最早合成基因网络：T. S. Gardner, C. R. Cantor, J. J. Collins, Nature 403, 339 (2000)；M. B. Elowitz, S. Leibler, Nature 403, 335 (2000) 临床应用示意图 合成生物学 细菌感染的治疗 抗生素杀菌都是诱导DNA损伤，会使细菌SOS系统激活 非裂解性M13（非裂解性可减少细菌适应系统的激活）通过遗传操作高表达lexA3（细菌SOS系统的抑制子）以及抗生素 癌症治疗 传统方法：手术，放射治疗，化疗 合成生物学： 1）构建只感染癌细胞的工程菌： 工程菌仅在缺氧环境下感染（缺氧环境通常是肿瘤组织的指示） 大肠杆菌表达入侵粘附蛋白（与哺乳动物整合素受体结合），启动子为厌氧诱导的甲酸脱氢酶启动子，因此工程菌仅在厌氧条件下感染肿瘤细胞。 2）工程菌抑制肿瘤相关基因的表达 工程菌通过RNAil抑制CTNNB1 （编码beta-1 catenin，连环蛋白） 表达，CTNNB1起始许多结肠癌的 发生 疫苗制备 合成脂质体，包裹有重组的细菌转录-翻译网络、编码抗原的DNA，可在体 内产生抗体 微生物组（microbiome）工程 在人体中寄生着数量巨大（1013～1014）的微生物。多种微生物参与人体发育、生理调节、免疫、营养吸收等各种生命活动中，与人类建立了稳定和谐的共生关系。这些微生物基因组统称为Microbiome，其基因总量大概是人类基因组中基因总量的一百倍，这些外源基因的参与可能是解释某些复杂生命科学问题的关键。Microbiome的研究中有两个基本的科学问题：是否存在一个核心的Microbiome构成为大部分人类所共有；人体内Microbiome的变化是否与人类健康存在必然联系。 大肠杆菌产生AI-2（autoinducer 2） 以分泌CAI-1（cholera autoinducer 1），从而产生毒素，杀死霍乱菌 合成生物学： Review Nagarajan Nandagopal and Michael B. Elowitz. Science 2011，333：1244-1248 合成生物学：最早，单个基因 现在，某个代谢、信号通路等中的多个基因 人工合成基因组：细菌 Science 2008, 319: 1215 合成酵母部分基因组：首次合成真核生物部分染色体 具有野生型相似的表型和适应性，无tRNA基因和转座子Jessica S. Dymond et al. 2011. Nature 477: 471-476 单分子技术 单分子技术：在单分子水平对生物大分子的行为（包括构象变化、相互 作用、相互识别等）进行实时﹑动态检测，以及在此基础 上的操纵﹑调控等，是纳米技术和分子生物物理学的自然 延伸和必然趋势。 生命单元的基本功能主要取决于单个大分子，与测量分子集合体整体性 质的传统方法(如光散射，光偏振，粘滞性等)相比，单分子技术具 有直接，准确，实时等优点 主要的研究手段有两种：1）单分子光谱学（Single-molecule spectroscopy 和Single-molecule FRET） 　　2）单分子力谱（AFM和光镊） 单分子技术实验指南，科学出版社，2010 单细胞技术 The Annual Review of Biomedical Engineering. 2010. 12:187–201 Microfluidic Platforms for Single-Cell Analysis Cell lysis DNA、RNA、蛋白质分析 PCR