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蛋白样品制备全攻略
双向电泳可不是一件容易的差事,花银子花时间不说,结果还很难重复。想要搞定双向电泳,关
键在于建立一套有效、可重复的样品制备方法。方法是多种多样的,不过都基本遵循以下的原则:
1. 样品缓冲液中离子浓度的控制 视,占了总蛋白的约 10-20%。这两种蛋白异
军突起,常常掩盖了其它类似大小的蛋白,使
2. 溶解包括疏水蛋白在内的所有蛋白质
我们无视低丰度蛋白的存在,也降低了双向电
3. 防止聚焦过程中已溶解蛋白质的聚焦和 泳的分辨率。因此,在分析目的蛋白之前,我
析出 们一定要先干掉白蛋白和 IgG 这两个家伙。
4. 防止样品制备过程中及其后蛋白样品的 样品中的核酸会对等电聚焦的结果产生干
酶或化学降解等的修饰反应 扰:DNA 复合物在变性条件下发生解离而使溶
5. 去除或完全降解核酸及其他干扰分子 液的粘稠度增加,可阻碍蛋白质进入 IPG 胶条,
并减慢蛋白质在胶条中的移动速度。DNA 也会
6. 去除高丰度或不相关的蛋白质,提高低
与样品中的某些蛋白质结合,出现人工假象和
丰度蛋白的浓度,使其达到检测要求
条纹。
提高分辨率和确保重复性是双向电泳实验
具体的解决方案如下:
最重要的两个目标。蛋白样品制备在实现这两
个目标的过程中起到了核心作用。Bio-Rad 公 去除盐分、去垢剂、脂类、酚类
司的 ReadyPrep 试剂盒通过试剂增溶或差异 ReadyPrep 2-D 净化试剂盒
溶解来减少脱尾或降低样品复杂性,从而成为
ReadyPrep 2-D 净化试剂盒可去除蛋白
用户可靠的实验工具。ReadyPrep 产品线包含
样品中的去垢剂、盐分、小肽、脂类和酚类化
一系列 2-D 样品制备试剂盒,不仅适用于通用
合物。这些物质会干扰双向电泳。本试剂盒含
样品(总蛋白)处理,而且可以将复杂样品按
有不受去垢剂、离液剂或其它实验中常用试剂
特定方法分级。处理通用样品的试剂盒包括总
干扰的沉淀试剂,可充分沉淀样品蛋白,并保
蛋白抽提和蛋白净化(clean-up )。样品分级试
证了蛋白样品的回收效率和浓度。
剂盒可用来降低样品复杂程度,同时有助于低
丰度蛋白的富集和鉴定。这类试剂盒又分为两 去除白蛋白
种,一种是基于蛋白不同的亚细胞定位来分离,
Aurum Affi–Gel 蓝胶小型试剂盒和层析
另一种是对细胞总蛋白进行分级,从而适合于
柱
总蛋白质组分析。
通过亲和层析,Affi–Gel 蓝胶能去除血清
从血清或血浆中提取的低丰
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