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基因表达谱芯片筛查子宫内膜癌相关基因-妇产科学专业论文
纂因表达谱芯片筛查于宫内膜痛相关基I丑称eDNA芯片或eDNA微阵列(cDNA—microarray)是近几年发展起来的一项前沿生物
纂因表达谱芯片筛查于宫内膜痛相关基I丑
称eDNA芯片或eDNA微阵列(cDNA—microarray)是近几年发展起来的一项前沿生物 技术一生物芯片中的一种,该技术具有高信息量、准确度高、自动化程度高等特点, 能对子宫内膜癌基因表达谱网络全面研究。
本课题采用的人类表达谱芯片CSC—GE一80,含8064条基因,涵盖了免疫、细 胞周期、细胞凋亡、细胞外基质、原癌基因/抑癌基因、代谢、运输、细胞信号传 导、DNA损伤修复等基因,可用于各种疾病或细胞模型中基因特异性表达变化的高 能量筛选。本课题用此芯片对ll例子宫内膜癌及正常增殖期子宫内膜癌组织的基 因表达情况进行比较,筛查子宫内膜癌的相关基因,对子宫内膜癌的发病机制及 其治疗提供有益的线索。
研究目的
1、应用基因芯片初步分析子宫内膜癌基因表达谱的变化,探讨子宫内膜癌发乍发 展的分子机理,筛选子宫内膜癌致病相关基因。
2、重点探讨细胞外基质调控、细胞因子相关基因的异常与临床意义,为子宫内膜 癌的诊断、治疗和预后提供理论依据。
3、筛选出在子宫内膜癌中特异表达且变化显著的摹因,在今后研究子宫内膜癌的 标志物或研制子宫内膜癌功能j占片提供依据。
材料与方法
本课题收集手术病理证实为子宫内膜癌的患者共11例,每例患者均取手术切 除的子宫内膜癌组织;并收集子宫肌瘤患者3例,每例患者在全子宫切除术后取 正常的子宫内膜组织,病理证实均为增殖期子宫内膜。先用Tri zo]提取组织总 RNA,然后进行RNA的纯化,用琼脂糖凝胶电泳和紫外光光度计检测RNA质量和样
品浓度及总量;对实验组(肿瘤组)混合样品和正常对照组混合样品进行配对, 其中肿瘤组混合样品总RNA采用反转录标记Cy5荧光分子,对照组混合样品采用 反转录标记Cy3荧光分子,与人类基因表达谱j出片杂交;完成两张芯片(编号分
Il
。中山大学|;『J属第三医院妇产科2006午硕上学位渔文
——
—— 苎里墨垄堕蔓丛堕垄王宴堕堕堕塑薹苎望
别为2000043924与2000043977);用软件ImageOuant(Amersham Pharmacia
Biotech,Ltd)扫描图像;用软件ArrayVision(Imaging Research,Ltd.)分析
芯片实验数据。
结果
子宫内膜癌表达谱的初步分析:在2张含8064个基因的基因芯片中筛选出11 例标本共差异基因274条,其中上调92条,下调182条。这些差异基因涉及细胞 外基质调节基因(如胶原酶、胶原等)、细胞因子(如三叶因子、铁传递蛋白等)、 促癌基因/抑癌基因、细胞周期、细胞凋亡、金属硫蛋白类等。
结论
l、子宫内膜癌表达谱的异常可能涉及到细胞外基质成分降解、细胞生长失控、细 胞信号紊乱等多方面的改变。
2、子宫内膜癌细胞外基质成分相关基因(如MMP、SPPl、胶原等)均在转录水平 发生了不同程度的改变。其中胶原酶的激活及胶原的抑制为肿瘤的侵袭与转移
创造条件。
3、子宫内膜癌中可见多数的生长因子(如IGF)下调表达,但某些与性激素调节 密切相关的细胞因子如铁传递蛋白、24p3等呈现出显著的上调表达。提示子宫 内膜癌与性激素调节关系密切的生物学特性。
关键词
子宫内膜癌,芯片,基因表达谱,细胞外基质,细胞因子
III
中山火学附属第三医院妇产科2006年碗上学位论文
基用表达谱芯片筛查子宫内膜癌相关拱吲Preliminary
基用表达谱芯片筛查子宫内膜癌相关拱吲
Preliminary study on gene expression profile of endometrial adenocarcinoma
Major:Gynecology Name:Shufang Huang Supervisor:Professor Xiaomao Li
ABSTRACT
Background
Endometrial carcinoma is familiar malignant tumor.Its incidence has raised year after year.The control of genes in endometrial carcinoma is a very complicated regulation network and involves many genes interaction.The appearance of microarray provides a powerful tool fur high throughout analysis all kinds of genes.It bases on th
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